Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms