Protein–RNA interactions for Protein: A6NEM1

GOLGA6L9, Golgin subfamily A member 6-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L9A6NEM1 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GOLGA6L9A6NEM1 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GOLGA6L9A6NEM1 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GOLGA6L9A6NEM1 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GOLGA6L9A6NEM1 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GOLGA6L9A6NEM1 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GOLGA6L9A6NEM1 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GOLGA6L9A6NEM1 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GOLGA6L9A6NEM1 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GOLGA6L9A6NEM1 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GOLGA6L9A6NEM1 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GOLGA6L9A6NEM1 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GOLGA6L9A6NEM1 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GOLGA6L9A6NEM1 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GOLGA6L9A6NEM1 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GOLGA6L9A6NEM1 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GOLGA6L9A6NEM1 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GOLGA6L9A6NEM1 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GOLGA6L9A6NEM1 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GOLGA6L9A6NEM1 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GOLGA6L9A6NEM1 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GOLGA6L9A6NEM1 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GOLGA6L9A6NEM1 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GOLGA6L9A6NEM1 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GOLGA6L9A6NEM1 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GOLGA6L9A6NEM1 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GOLGA6L9A6NEM1 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GOLGA6L9A6NEM1 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GOLGA6L9A6NEM1 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GOLGA6L9A6NEM1 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GOLGA6L9A6NEM1 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GOLGA6L9A6NEM1 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GOLGA6L9A6NEM1 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GOLGA6L9A6NEM1 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GOLGA6L9A6NEM1 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GOLGA6L9A6NEM1 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GOLGA6L9A6NEM1 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GOLGA6L9A6NEM1 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GOLGA6L9A6NEM1 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GOLGA6L9A6NEM1 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GOLGA6L9A6NEM1 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GOLGA6L9A6NEM1 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GOLGA6L9A6NEM1 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GOLGA6L9A6NEM1 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GOLGA6L9A6NEM1 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GOLGA6L9A6NEM1 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GOLGA6L9A6NEM1 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GOLGA6L9A6NEM1 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GOLGA6L9A6NEM1 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GOLGA6L9A6NEM1 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GOLGA6L9A6NEM1 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
GOLGA6L9A6NEM1 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GOLGA6L9A6NEM1 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GOLGA6L9A6NEM1 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GOLGA6L9A6NEM1 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GOLGA6L9A6NEM1 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GOLGA6L9A6NEM1 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GOLGA6L9A6NEM1 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GOLGA6L9A6NEM1 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GOLGA6L9A6NEM1 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GOLGA6L9A6NEM1 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
GOLGA6L9A6NEM1 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
GOLGA6L9A6NEM1 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
GOLGA6L9A6NEM1 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
GOLGA6L9A6NEM1 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GOLGA6L9A6NEM1 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GOLGA6L9A6NEM1 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GOLGA6L9A6NEM1 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GOLGA6L9A6NEM1 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GOLGA6L9A6NEM1 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GOLGA6L9A6NEM1 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GOLGA6L9A6NEM1 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GOLGA6L9A6NEM1 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GOLGA6L9A6NEM1 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GOLGA6L9A6NEM1 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GOLGA6L9A6NEM1 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GOLGA6L9A6NEM1 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GOLGA6L9A6NEM1 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GOLGA6L9A6NEM1 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GOLGA6L9A6NEM1 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GOLGA6L9A6NEM1 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GOLGA6L9A6NEM1 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GOLGA6L9A6NEM1 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GOLGA6L9A6NEM1 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GOLGA6L9A6NEM1 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GOLGA6L9A6NEM1 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
GOLGA6L9A6NEM1 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GOLGA6L9A6NEM1 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GOLGA6L9A6NEM1 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GOLGA6L9A6NEM1 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GOLGA6L9A6NEM1 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GOLGA6L9A6NEM1 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
GOLGA6L9A6NEM1 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GOLGA6L9A6NEM1 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GOLGA6L9A6NEM1 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GOLGA6L9A6NEM1 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GOLGA6L9A6NEM1 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GOLGA6L9A6NEM1 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GOLGA6L9A6NEM1 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
GOLGA6L9A6NEM1 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms