Protein–RNA interactions for Protein: A6NCF5

KLHL33, Kelch-like protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL33A6NCF5 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 ZDHHC8-203ENST00000405930 3112 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 ZNRF3-202ENST00000406323 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms