Protein–RNA interactions for Protein: A4FU01

MTMR11, Myotubularin-related protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR11A4FU01 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MTMR11A4FU01 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MTMR11A4FU01 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MTMR11A4FU01 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MTMR11A4FU01 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MTMR11A4FU01 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MTMR11A4FU01 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MTMR11A4FU01 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MTMR11A4FU01 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MTMR11A4FU01 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MTMR11A4FU01 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MTMR11A4FU01 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
MTMR11A4FU01 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
MTMR11A4FU01 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
MTMR11A4FU01 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
MTMR11A4FU01 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MTMR11A4FU01 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MTMR11A4FU01 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MTMR11A4FU01 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MTMR11A4FU01 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MTMR11A4FU01 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MTMR11A4FU01 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MTMR11A4FU01 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MTMR11A4FU01 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MTMR11A4FU01 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MTMR11A4FU01 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MTMR11A4FU01 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MTMR11A4FU01 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MTMR11A4FU01 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MTMR11A4FU01 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MTMR11A4FU01 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MTMR11A4FU01 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MTMR11A4FU01 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MTMR11A4FU01 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MTMR11A4FU01 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
MTMR11A4FU01 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
MTMR11A4FU01 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MTMR11A4FU01 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MTMR11A4FU01 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MTMR11A4FU01 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MTMR11A4FU01 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MTMR11A4FU01 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MTMR11A4FU01 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MTMR11A4FU01 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MTMR11A4FU01 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MTMR11A4FU01 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MTMR11A4FU01 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MTMR11A4FU01 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MTMR11A4FU01 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MTMR11A4FU01 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MTMR11A4FU01 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MTMR11A4FU01 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MTMR11A4FU01 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MTMR11A4FU01 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MTMR11A4FU01 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MTMR11A4FU01 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MTMR11A4FU01 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MTMR11A4FU01 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MTMR11A4FU01 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MTMR11A4FU01 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MTMR11A4FU01 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MTMR11A4FU01 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MTMR11A4FU01 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
MTMR11A4FU01 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MTMR11A4FU01 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MTMR11A4FU01 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MTMR11A4FU01 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MTMR11A4FU01 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MTMR11A4FU01 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MTMR11A4FU01 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MTMR11A4FU01 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MTMR11A4FU01 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MTMR11A4FU01 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MTMR11A4FU01 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MTMR11A4FU01 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MTMR11A4FU01 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MTMR11A4FU01 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MTMR11A4FU01 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MTMR11A4FU01 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MTMR11A4FU01 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MTMR11A4FU01 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MTMR11A4FU01 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MTMR11A4FU01 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MTMR11A4FU01 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MTMR11A4FU01 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MTMR11A4FU01 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MTMR11A4FU01 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MTMR11A4FU01 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MTMR11A4FU01 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MTMR11A4FU01 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MTMR11A4FU01 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
MTMR11A4FU01 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MTMR11A4FU01 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MTMR11A4FU01 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MTMR11A4FU01 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MTMR11A4FU01 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MTMR11A4FU01 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MTMR11A4FU01 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MTMR11A4FU01 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MTMR11A4FU01 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms