Protein–RNA interactions for Protein: A2A3N6

PIPSL, Putative PIP5K1A and PSMD4-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIPSLA2A3N6 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PIPSLA2A3N6 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PIPSLA2A3N6 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PIPSLA2A3N6 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PIPSLA2A3N6 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PIPSLA2A3N6 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PIPSLA2A3N6 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PIPSLA2A3N6 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PIPSLA2A3N6 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PIPSLA2A3N6 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PIPSLA2A3N6 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PIPSLA2A3N6 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PIPSLA2A3N6 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PIPSLA2A3N6 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PIPSLA2A3N6 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PIPSLA2A3N6 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PIPSLA2A3N6 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PIPSLA2A3N6 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PIPSLA2A3N6 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PIPSLA2A3N6 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PIPSLA2A3N6 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PIPSLA2A3N6 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PIPSLA2A3N6 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PIPSLA2A3N6 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PIPSLA2A3N6 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PIPSLA2A3N6 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PIPSLA2A3N6 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PIPSLA2A3N6 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PIPSLA2A3N6 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PIPSLA2A3N6 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PIPSLA2A3N6 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PIPSLA2A3N6 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PIPSLA2A3N6 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PIPSLA2A3N6 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PIPSLA2A3N6 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PIPSLA2A3N6 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PIPSLA2A3N6 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PIPSLA2A3N6 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PIPSLA2A3N6 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PIPSLA2A3N6 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PIPSLA2A3N6 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PIPSLA2A3N6 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms