Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4X4

KLF12, Krueppel-like factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF12Q9Y4X4 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
KLF12Q9Y4X4 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
KLF12Q9Y4X4 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
KLF12Q9Y4X4 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
KLF12Q9Y4X4 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
KLF12Q9Y4X4 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
KLF12Q9Y4X4 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
KLF12Q9Y4X4 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
KLF12Q9Y4X4 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
KLF12Q9Y4X4 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
KLF12Q9Y4X4 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
KLF12Q9Y4X4 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
KLF12Q9Y4X4 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
KLF12Q9Y4X4 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
KLF12Q9Y4X4 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
KLF12Q9Y4X4 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
KLF12Q9Y4X4 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
KLF12Q9Y4X4 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
KLF12Q9Y4X4 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
KLF12Q9Y4X4 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
KLF12Q9Y4X4 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
KLF12Q9Y4X4 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
KLF12Q9Y4X4 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
KLF12Q9Y4X4 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
KLF12Q9Y4X4 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
KLF12Q9Y4X4 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
KLF12Q9Y4X4 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
KLF12Q9Y4X4 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
KLF12Q9Y4X4 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
KLF12Q9Y4X4 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
KLF12Q9Y4X4 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC12.09□□□□□ -0.47
KLF12Q9Y4X4 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
KLF12Q9Y4X4 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
KLF12Q9Y4X4 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC12.09□□□□□ -0.47
KLF12Q9Y4X4 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
KLF12Q9Y4X4 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
KLF12Q9Y4X4 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC12.09□□□□□ -0.47
KLF12Q9Y4X4 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC12.09□□□□□ -0.47
KLF12Q9Y4X4 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
KLF12Q9Y4X4 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
KLF12Q9Y4X4 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
KLF12Q9Y4X4 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
KLF12Q9Y4X4 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
KLF12Q9Y4X4 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
KLF12Q9Y4X4 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
KLF12Q9Y4X4 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
KLF12Q9Y4X4 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
KLF12Q9Y4X4 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
KLF12Q9Y4X4 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
KLF12Q9Y4X4 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
KLF12Q9Y4X4 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
KLF12Q9Y4X4 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
KLF12Q9Y4X4 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
KLF12Q9Y4X4 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
KLF12Q9Y4X4 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
KLF12Q9Y4X4 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
KLF12Q9Y4X4 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
KLF12Q9Y4X4 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
KLF12Q9Y4X4 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
KLF12Q9Y4X4 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
KLF12Q9Y4X4 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
KLF12Q9Y4X4 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
KLF12Q9Y4X4 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
KLF12Q9Y4X4 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
KLF12Q9Y4X4 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
KLF12Q9Y4X4 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
KLF12Q9Y4X4 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
KLF12Q9Y4X4 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
KLF12Q9Y4X4 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
KLF12Q9Y4X4 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
KLF12Q9Y4X4 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
KLF12Q9Y4X4 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
KLF12Q9Y4X4 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
KLF12Q9Y4X4 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
KLF12Q9Y4X4 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
KLF12Q9Y4X4 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
KLF12Q9Y4X4 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
KLF12Q9Y4X4 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
KLF12Q9Y4X4 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
KLF12Q9Y4X4 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
KLF12Q9Y4X4 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
KLF12Q9Y4X4 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
KLF12Q9Y4X4 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
KLF12Q9Y4X4 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
KLF12Q9Y4X4 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
KLF12Q9Y4X4 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
KLF12Q9Y4X4 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
KLF12Q9Y4X4 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
KLF12Q9Y4X4 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
KLF12Q9Y4X4 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
KLF12Q9Y4X4 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
KLF12Q9Y4X4 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
KLF12Q9Y4X4 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
KLF12Q9Y4X4 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC12.08□□□□□ -0.48
KLF12Q9Y4X4 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
KLF12Q9Y4X4 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
KLF12Q9Y4X4 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
KLF12Q9Y4X4 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
KLF12Q9Y4X4 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
KLF12Q9Y4X4 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms