Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN81

L1RE1, LINE-1 retrotransposable element ORF1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1RE1Q9UN81 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
L1RE1Q9UN81 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
L1RE1Q9UN81 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
L1RE1Q9UN81 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
L1RE1Q9UN81 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
L1RE1Q9UN81 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
L1RE1Q9UN81 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
L1RE1Q9UN81 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
L1RE1Q9UN81 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
L1RE1Q9UN81 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
L1RE1Q9UN81 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
L1RE1Q9UN81 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
L1RE1Q9UN81 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
L1RE1Q9UN81 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
L1RE1Q9UN81 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
L1RE1Q9UN81 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
L1RE1Q9UN81 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
L1RE1Q9UN81 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
L1RE1Q9UN81 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
L1RE1Q9UN81 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
L1RE1Q9UN81 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
L1RE1Q9UN81 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
L1RE1Q9UN81 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
L1RE1Q9UN81 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
L1RE1Q9UN81 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
L1RE1Q9UN81 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
L1RE1Q9UN81 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
L1RE1Q9UN81 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
L1RE1Q9UN81 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
L1RE1Q9UN81 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
L1RE1Q9UN81 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
L1RE1Q9UN81 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
L1RE1Q9UN81 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
L1RE1Q9UN81 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
L1RE1Q9UN81 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
L1RE1Q9UN81 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
L1RE1Q9UN81 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
L1RE1Q9UN81 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
L1RE1Q9UN81 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
L1RE1Q9UN81 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
L1RE1Q9UN81 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
L1RE1Q9UN81 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
L1RE1Q9UN81 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
L1RE1Q9UN81 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
L1RE1Q9UN81 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
L1RE1Q9UN81 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
L1RE1Q9UN81 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
L1RE1Q9UN81 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
L1RE1Q9UN81 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
L1RE1Q9UN81 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
L1RE1Q9UN81 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
L1RE1Q9UN81 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
L1RE1Q9UN81 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
L1RE1Q9UN81 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
L1RE1Q9UN81 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
L1RE1Q9UN81 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
L1RE1Q9UN81 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
L1RE1Q9UN81 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
L1RE1Q9UN81 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
L1RE1Q9UN81 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
L1RE1Q9UN81 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
L1RE1Q9UN81 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
L1RE1Q9UN81 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
L1RE1Q9UN81 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
L1RE1Q9UN81 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
L1RE1Q9UN81 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
L1RE1Q9UN81 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
L1RE1Q9UN81 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
L1RE1Q9UN81 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
L1RE1Q9UN81 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
L1RE1Q9UN81 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
L1RE1Q9UN81 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
L1RE1Q9UN81 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
L1RE1Q9UN81 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
L1RE1Q9UN81 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
L1RE1Q9UN81 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
L1RE1Q9UN81 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
L1RE1Q9UN81 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
L1RE1Q9UN81 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
L1RE1Q9UN81 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
L1RE1Q9UN81 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
L1RE1Q9UN81 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
L1RE1Q9UN81 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
L1RE1Q9UN81 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
L1RE1Q9UN81 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
L1RE1Q9UN81 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
L1RE1Q9UN81 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
L1RE1Q9UN81 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
L1RE1Q9UN81 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
L1RE1Q9UN81 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
L1RE1Q9UN81 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
L1RE1Q9UN81 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
L1RE1Q9UN81 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
L1RE1Q9UN81 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
L1RE1Q9UN81 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
L1RE1Q9UN81 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
L1RE1Q9UN81 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
L1RE1Q9UN81 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
L1RE1Q9UN81 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
L1RE1Q9UN81 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms