Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHJ3

SFMBT1, Scm-like with four MBT domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFMBT1Q9UHJ3 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SFMBT1Q9UHJ3 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SFMBT1Q9UHJ3 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SFMBT1Q9UHJ3 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SFMBT1Q9UHJ3 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SFMBT1Q9UHJ3 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SFMBT1Q9UHJ3 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SFMBT1Q9UHJ3 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SFMBT1Q9UHJ3 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SFMBT1Q9UHJ3 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SFMBT1Q9UHJ3 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SFMBT1Q9UHJ3 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SFMBT1Q9UHJ3 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SFMBT1Q9UHJ3 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SFMBT1Q9UHJ3 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SFMBT1Q9UHJ3 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SFMBT1Q9UHJ3 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SFMBT1Q9UHJ3 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SFMBT1Q9UHJ3 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SFMBT1Q9UHJ3 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SFMBT1Q9UHJ3 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SFMBT1Q9UHJ3 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SFMBT1Q9UHJ3 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SFMBT1Q9UHJ3 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SFMBT1Q9UHJ3 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SFMBT1Q9UHJ3 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SFMBT1Q9UHJ3 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SFMBT1Q9UHJ3 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SFMBT1Q9UHJ3 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SFMBT1Q9UHJ3 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SFMBT1Q9UHJ3 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SFMBT1Q9UHJ3 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SFMBT1Q9UHJ3 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SFMBT1Q9UHJ3 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SFMBT1Q9UHJ3 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SFMBT1Q9UHJ3 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SFMBT1Q9UHJ3 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SFMBT1Q9UHJ3 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SFMBT1Q9UHJ3 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SFMBT1Q9UHJ3 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SFMBT1Q9UHJ3 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SFMBT1Q9UHJ3 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SFMBT1Q9UHJ3 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SFMBT1Q9UHJ3 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SFMBT1Q9UHJ3 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SFMBT1Q9UHJ3 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SFMBT1Q9UHJ3 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SFMBT1Q9UHJ3 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SFMBT1Q9UHJ3 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SFMBT1Q9UHJ3 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SFMBT1Q9UHJ3 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SFMBT1Q9UHJ3 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SFMBT1Q9UHJ3 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SFMBT1Q9UHJ3 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SFMBT1Q9UHJ3 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SFMBT1Q9UHJ3 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SFMBT1Q9UHJ3 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SFMBT1Q9UHJ3 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SFMBT1Q9UHJ3 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SFMBT1Q9UHJ3 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SFMBT1Q9UHJ3 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SFMBT1Q9UHJ3 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SFMBT1Q9UHJ3 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SFMBT1Q9UHJ3 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SFMBT1Q9UHJ3 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SFMBT1Q9UHJ3 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SFMBT1Q9UHJ3 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SFMBT1Q9UHJ3 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SFMBT1Q9UHJ3 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SFMBT1Q9UHJ3 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SFMBT1Q9UHJ3 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SFMBT1Q9UHJ3 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SFMBT1Q9UHJ3 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SFMBT1Q9UHJ3 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SFMBT1Q9UHJ3 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFMBT1Q9UHJ3 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFMBT1Q9UHJ3 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFMBT1Q9UHJ3 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFMBT1Q9UHJ3 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFMBT1Q9UHJ3 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFMBT1Q9UHJ3 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFMBT1Q9UHJ3 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFMBT1Q9UHJ3 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFMBT1Q9UHJ3 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFMBT1Q9UHJ3 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFMBT1Q9UHJ3 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFMBT1Q9UHJ3 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFMBT1Q9UHJ3 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFMBT1Q9UHJ3 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFMBT1Q9UHJ3 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SFMBT1Q9UHJ3 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFMBT1Q9UHJ3 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFMBT1Q9UHJ3 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFMBT1Q9UHJ3 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFMBT1Q9UHJ3 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFMBT1Q9UHJ3 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFMBT1Q9UHJ3 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFMBT1Q9UHJ3 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.4 ms