Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
POLKQ9UBT6 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
POLKQ9UBT6 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
POLKQ9UBT6 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
POLKQ9UBT6 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
POLKQ9UBT6 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
POLKQ9UBT6 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
POLKQ9UBT6 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
POLKQ9UBT6 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
POLKQ9UBT6 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
POLKQ9UBT6 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
POLKQ9UBT6 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
POLKQ9UBT6 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
POLKQ9UBT6 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
POLKQ9UBT6 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
POLKQ9UBT6 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
POLKQ9UBT6 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
POLKQ9UBT6 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
POLKQ9UBT6 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
POLKQ9UBT6 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
POLKQ9UBT6 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
POLKQ9UBT6 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
POLKQ9UBT6 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
POLKQ9UBT6 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
POLKQ9UBT6 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
POLKQ9UBT6 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
POLKQ9UBT6 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
POLKQ9UBT6 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
POLKQ9UBT6 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
POLKQ9UBT6 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
POLKQ9UBT6 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
POLKQ9UBT6 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
POLKQ9UBT6 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
POLKQ9UBT6 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
POLKQ9UBT6 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
POLKQ9UBT6 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
POLKQ9UBT6 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
POLKQ9UBT6 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
POLKQ9UBT6 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
POLKQ9UBT6 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
POLKQ9UBT6 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
POLKQ9UBT6 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
POLKQ9UBT6 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
POLKQ9UBT6 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
POLKQ9UBT6 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
POLKQ9UBT6 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
POLKQ9UBT6 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
POLKQ9UBT6 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
POLKQ9UBT6 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
POLKQ9UBT6 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
POLKQ9UBT6 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
POLKQ9UBT6 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
POLKQ9UBT6 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
POLKQ9UBT6 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
POLKQ9UBT6 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
POLKQ9UBT6 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
POLKQ9UBT6 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
POLKQ9UBT6 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
POLKQ9UBT6 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
POLKQ9UBT6 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
POLKQ9UBT6 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
POLKQ9UBT6 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
POLKQ9UBT6 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
POLKQ9UBT6 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
POLKQ9UBT6 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
POLKQ9UBT6 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
POLKQ9UBT6 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
POLKQ9UBT6 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
POLKQ9UBT6 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
POLKQ9UBT6 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
POLKQ9UBT6 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
POLKQ9UBT6 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
POLKQ9UBT6 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
POLKQ9UBT6 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
POLKQ9UBT6 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
POLKQ9UBT6 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
POLKQ9UBT6 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
POLKQ9UBT6 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
POLKQ9UBT6 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
POLKQ9UBT6 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
POLKQ9UBT6 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
POLKQ9UBT6 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
POLKQ9UBT6 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
POLKQ9UBT6 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
POLKQ9UBT6 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
POLKQ9UBT6 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
POLKQ9UBT6 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
POLKQ9UBT6 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
POLKQ9UBT6 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
POLKQ9UBT6 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
POLKQ9UBT6 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
POLKQ9UBT6 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
POLKQ9UBT6 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
POLKQ9UBT6 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
POLKQ9UBT6 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
POLKQ9UBT6 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
POLKQ9UBT6 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
POLKQ9UBT6 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
POLKQ9UBT6 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
POLKQ9UBT6 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms