Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSU2

TREX1, Three-prime repair exonuclease 1, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX1Q9NSU2 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms