Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS4

TMPRSS4, Transmembrane protease serine 4, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS4Q9NRS4 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMPRSS4Q9NRS4 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMPRSS4Q9NRS4 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMPRSS4Q9NRS4 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMPRSS4Q9NRS4 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMPRSS4Q9NRS4 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMPRSS4Q9NRS4 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TMPRSS4Q9NRS4 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMPRSS4Q9NRS4 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMPRSS4Q9NRS4 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMPRSS4Q9NRS4 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMPRSS4Q9NRS4 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMPRSS4Q9NRS4 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMPRSS4Q9NRS4 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMPRSS4Q9NRS4 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMPRSS4Q9NRS4 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMPRSS4Q9NRS4 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMPRSS4Q9NRS4 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMPRSS4Q9NRS4 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TMPRSS4Q9NRS4 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMPRSS4Q9NRS4 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMPRSS4Q9NRS4 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMPRSS4Q9NRS4 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMPRSS4Q9NRS4 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMPRSS4Q9NRS4 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMPRSS4Q9NRS4 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMPRSS4Q9NRS4 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMPRSS4Q9NRS4 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMPRSS4Q9NRS4 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMPRSS4Q9NRS4 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMPRSS4Q9NRS4 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMPRSS4Q9NRS4 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMPRSS4Q9NRS4 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMPRSS4Q9NRS4 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMPRSS4Q9NRS4 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMPRSS4Q9NRS4 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TMPRSS4Q9NRS4 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMPRSS4Q9NRS4 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMPRSS4Q9NRS4 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMPRSS4Q9NRS4 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMPRSS4Q9NRS4 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMPRSS4Q9NRS4 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMPRSS4Q9NRS4 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMPRSS4Q9NRS4 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMPRSS4Q9NRS4 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMPRSS4Q9NRS4 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMPRSS4Q9NRS4 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMPRSS4Q9NRS4 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMPRSS4Q9NRS4 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TMPRSS4Q9NRS4 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMPRSS4Q9NRS4 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMPRSS4Q9NRS4 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMPRSS4Q9NRS4 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMPRSS4Q9NRS4 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMPRSS4Q9NRS4 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMPRSS4Q9NRS4 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMPRSS4Q9NRS4 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMPRSS4Q9NRS4 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMPRSS4Q9NRS4 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMPRSS4Q9NRS4 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMPRSS4Q9NRS4 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMPRSS4Q9NRS4 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMPRSS4Q9NRS4 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMPRSS4Q9NRS4 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMPRSS4Q9NRS4 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TMPRSS4Q9NRS4 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TMPRSS4Q9NRS4 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMPRSS4Q9NRS4 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMPRSS4Q9NRS4 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMPRSS4Q9NRS4 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMPRSS4Q9NRS4 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TMPRSS4Q9NRS4 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMPRSS4Q9NRS4 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMPRSS4Q9NRS4 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMPRSS4Q9NRS4 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMPRSS4Q9NRS4 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMPRSS4Q9NRS4 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMPRSS4Q9NRS4 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMPRSS4Q9NRS4 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMPRSS4Q9NRS4 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMPRSS4Q9NRS4 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMPRSS4Q9NRS4 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMPRSS4Q9NRS4 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMPRSS4Q9NRS4 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMPRSS4Q9NRS4 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMPRSS4Q9NRS4 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMPRSS4Q9NRS4 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMPRSS4Q9NRS4 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMPRSS4Q9NRS4 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMPRSS4Q9NRS4 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMPRSS4Q9NRS4 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMPRSS4Q9NRS4 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMPRSS4Q9NRS4 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMPRSS4Q9NRS4 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMPRSS4Q9NRS4 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMPRSS4Q9NRS4 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMPRSS4Q9NRS4 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMPRSS4Q9NRS4 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMPRSS4Q9NRS4 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMPRSS4Q9NRS4 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms