Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP91

SLC6A20, Sodium- and chloride-dependent transporter XTRP3, humanhuman

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Length 592 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A20Q9NP91 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC6A20Q9NP91 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC6A20Q9NP91 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC6A20Q9NP91 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC6A20Q9NP91 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC6A20Q9NP91 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC6A20Q9NP91 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC6A20Q9NP91 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC6A20Q9NP91 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC6A20Q9NP91 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC6A20Q9NP91 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC6A20Q9NP91 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC6A20Q9NP91 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC6A20Q9NP91 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC6A20Q9NP91 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC6A20Q9NP91 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC6A20Q9NP91 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC6A20Q9NP91 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC6A20Q9NP91 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC6A20Q9NP91 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC6A20Q9NP91 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC6A20Q9NP91 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC6A20Q9NP91 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC6A20Q9NP91 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC6A20Q9NP91 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC6A20Q9NP91 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC6A20Q9NP91 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC6A20Q9NP91 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC6A20Q9NP91 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC6A20Q9NP91 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC6A20Q9NP91 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC6A20Q9NP91 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC6A20Q9NP91 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC6A20Q9NP91 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC6A20Q9NP91 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC6A20Q9NP91 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC6A20Q9NP91 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC6A20Q9NP91 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC6A20Q9NP91 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC6A20Q9NP91 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC6A20Q9NP91 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC6A20Q9NP91 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC6A20Q9NP91 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC6A20Q9NP91 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC6A20Q9NP91 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC6A20Q9NP91 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC6A20Q9NP91 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC6A20Q9NP91 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC6A20Q9NP91 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC6A20Q9NP91 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC6A20Q9NP91 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC6A20Q9NP91 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC6A20Q9NP91 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC6A20Q9NP91 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC6A20Q9NP91 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC6A20Q9NP91 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC6A20Q9NP91 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC6A20Q9NP91 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC6A20Q9NP91 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC6A20Q9NP91 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC6A20Q9NP91 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC6A20Q9NP91 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC6A20Q9NP91 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC6A20Q9NP91 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC6A20Q9NP91 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC6A20Q9NP91 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC6A20Q9NP91 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC6A20Q9NP91 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC6A20Q9NP91 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC6A20Q9NP91 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC6A20Q9NP91 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC6A20Q9NP91 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC6A20Q9NP91 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC6A20Q9NP91 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC6A20Q9NP91 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC6A20Q9NP91 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC6A20Q9NP91 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC6A20Q9NP91 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC6A20Q9NP91 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC6A20Q9NP91 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC6A20Q9NP91 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC6A20Q9NP91 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC6A20Q9NP91 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC6A20Q9NP91 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC6A20Q9NP91 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC6A20Q9NP91 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC6A20Q9NP91 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC6A20Q9NP91 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC6A20Q9NP91 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC6A20Q9NP91 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC6A20Q9NP91 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC6A20Q9NP91 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC6A20Q9NP91 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC6A20Q9NP91 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC6A20Q9NP91 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC6A20Q9NP91 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC6A20Q9NP91 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC6A20Q9NP91 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC6A20Q9NP91 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC6A20Q9NP91 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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