Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP64

ZCCHC17, Nucleolar protein of 40 kDa, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC17Q9NP64 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ZCCHC17Q9NP64 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZCCHC17Q9NP64 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZCCHC17Q9NP64 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZCCHC17Q9NP64 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ZCCHC17Q9NP64 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZCCHC17Q9NP64 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZCCHC17Q9NP64 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZCCHC17Q9NP64 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZCCHC17Q9NP64 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZCCHC17Q9NP64 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZCCHC17Q9NP64 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZCCHC17Q9NP64 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZCCHC17Q9NP64 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZCCHC17Q9NP64 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZCCHC17Q9NP64 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZCCHC17Q9NP64 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZCCHC17Q9NP64 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZCCHC17Q9NP64 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZCCHC17Q9NP64 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZCCHC17Q9NP64 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZCCHC17Q9NP64 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZCCHC17Q9NP64 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZCCHC17Q9NP64 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZCCHC17Q9NP64 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ZCCHC17Q9NP64 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZCCHC17Q9NP64 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZCCHC17Q9NP64 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZCCHC17Q9NP64 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZCCHC17Q9NP64 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZCCHC17Q9NP64 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZCCHC17Q9NP64 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ZCCHC17Q9NP64 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ZCCHC17Q9NP64 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZCCHC17Q9NP64 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZCCHC17Q9NP64 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZCCHC17Q9NP64 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZCCHC17Q9NP64 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZCCHC17Q9NP64 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZCCHC17Q9NP64 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZCCHC17Q9NP64 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZCCHC17Q9NP64 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZCCHC17Q9NP64 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZCCHC17Q9NP64 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZCCHC17Q9NP64 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZCCHC17Q9NP64 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ZCCHC17Q9NP64 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ZCCHC17Q9NP64 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZCCHC17Q9NP64 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZCCHC17Q9NP64 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZCCHC17Q9NP64 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZCCHC17Q9NP64 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZCCHC17Q9NP64 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZCCHC17Q9NP64 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZCCHC17Q9NP64 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZCCHC17Q9NP64 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZCCHC17Q9NP64 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZCCHC17Q9NP64 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZCCHC17Q9NP64 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZCCHC17Q9NP64 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZCCHC17Q9NP64 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZCCHC17Q9NP64 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZCCHC17Q9NP64 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ZCCHC17Q9NP64 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZCCHC17Q9NP64 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ZCCHC17Q9NP64 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZCCHC17Q9NP64 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZCCHC17Q9NP64 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZCCHC17Q9NP64 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZCCHC17Q9NP64 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZCCHC17Q9NP64 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZCCHC17Q9NP64 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZCCHC17Q9NP64 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ZCCHC17Q9NP64 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZCCHC17Q9NP64 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ZCCHC17Q9NP64 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZCCHC17Q9NP64 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZCCHC17Q9NP64 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZCCHC17Q9NP64 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZCCHC17Q9NP64 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZCCHC17Q9NP64 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZCCHC17Q9NP64 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZCCHC17Q9NP64 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZCCHC17Q9NP64 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZCCHC17Q9NP64 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZCCHC17Q9NP64 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZCCHC17Q9NP64 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZCCHC17Q9NP64 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZCCHC17Q9NP64 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZCCHC17Q9NP64 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZCCHC17Q9NP64 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZCCHC17Q9NP64 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZCCHC17Q9NP64 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZCCHC17Q9NP64 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZCCHC17Q9NP64 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZCCHC17Q9NP64 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZCCHC17Q9NP64 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZCCHC17Q9NP64 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZCCHC17Q9NP64 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZCCHC17Q9NP64 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.2 ms