Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY07

SLC4A5, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A5Q9BY07 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC4A5Q9BY07 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC4A5Q9BY07 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC4A5Q9BY07 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC4A5Q9BY07 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC4A5Q9BY07 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC4A5Q9BY07 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC4A5Q9BY07 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC4A5Q9BY07 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC4A5Q9BY07 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC4A5Q9BY07 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC4A5Q9BY07 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC4A5Q9BY07 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC4A5Q9BY07 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC4A5Q9BY07 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC4A5Q9BY07 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC4A5Q9BY07 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC4A5Q9BY07 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC4A5Q9BY07 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC4A5Q9BY07 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC4A5Q9BY07 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC4A5Q9BY07 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC4A5Q9BY07 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC4A5Q9BY07 OR5D16-201ENST00000378396 987 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC4A5Q9BY07 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC4A5Q9BY07 AC010967.1-201ENST00000421575 489 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC4A5Q9BY07 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC4A5Q9BY07 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC4A5Q9BY07 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC4A5Q9BY07 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC4A5Q9BY07 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC4A5Q9BY07 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC4A5Q9BY07 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC4A5Q9BY07 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC4A5Q9BY07 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC4A5Q9BY07 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC4A5Q9BY07 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC4A5Q9BY07 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC4A5Q9BY07 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC4A5Q9BY07 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC4A5Q9BY07 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC4A5Q9BY07 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC4A5Q9BY07 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC4A5Q9BY07 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC4A5Q9BY07 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC4A5Q9BY07 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC4A5Q9BY07 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC4A5Q9BY07 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC4A5Q9BY07 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC4A5Q9BY07 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC4A5Q9BY07 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC4A5Q9BY07 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC4A5Q9BY07 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC4A5Q9BY07 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC4A5Q9BY07 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC4A5Q9BY07 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC4A5Q9BY07 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC4A5Q9BY07 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC4A5Q9BY07 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC4A5Q9BY07 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC4A5Q9BY07 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC4A5Q9BY07 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC4A5Q9BY07 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC4A5Q9BY07 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC4A5Q9BY07 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC4A5Q9BY07 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC4A5Q9BY07 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC4A5Q9BY07 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC4A5Q9BY07 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC4A5Q9BY07 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC4A5Q9BY07 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC4A5Q9BY07 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC4A5Q9BY07 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC4A5Q9BY07 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC4A5Q9BY07 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC4A5Q9BY07 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC4A5Q9BY07 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC4A5Q9BY07 AC084024.3-201ENST00000520598 562 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC4A5Q9BY07 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC4A5Q9BY07 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC4A5Q9BY07 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC4A5Q9BY07 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC4A5Q9BY07 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC4A5Q9BY07 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC4A5Q9BY07 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC4A5Q9BY07 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC4A5Q9BY07 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC4A5Q9BY07 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC4A5Q9BY07 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC4A5Q9BY07 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC4A5Q9BY07 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC4A5Q9BY07 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC4A5Q9BY07 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC4A5Q9BY07 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC4A5Q9BY07 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC4A5Q9BY07 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC4A5Q9BY07 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC4A5Q9BY07 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC4A5Q9BY07 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC4A5Q9BY07 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms