Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXB7

SPATA16, Spermatogenesis-associated protein 16, humanhuman

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATA16Q9BXB7 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPATA16Q9BXB7 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPATA16Q9BXB7 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SPATA16Q9BXB7 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPATA16Q9BXB7 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPATA16Q9BXB7 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SPATA16Q9BXB7 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPATA16Q9BXB7 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPATA16Q9BXB7 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPATA16Q9BXB7 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPATA16Q9BXB7 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPATA16Q9BXB7 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SPATA16Q9BXB7 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPATA16Q9BXB7 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPATA16Q9BXB7 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPATA16Q9BXB7 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPATA16Q9BXB7 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SPATA16Q9BXB7 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPATA16Q9BXB7 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPATA16Q9BXB7 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPATA16Q9BXB7 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPATA16Q9BXB7 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPATA16Q9BXB7 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPATA16Q9BXB7 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPATA16Q9BXB7 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPATA16Q9BXB7 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPATA16Q9BXB7 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPATA16Q9BXB7 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPATA16Q9BXB7 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPATA16Q9BXB7 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPATA16Q9BXB7 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPATA16Q9BXB7 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPATA16Q9BXB7 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPATA16Q9BXB7 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPATA16Q9BXB7 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPATA16Q9BXB7 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPATA16Q9BXB7 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPATA16Q9BXB7 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPATA16Q9BXB7 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPATA16Q9BXB7 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPATA16Q9BXB7 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPATA16Q9BXB7 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPATA16Q9BXB7 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPATA16Q9BXB7 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPATA16Q9BXB7 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPATA16Q9BXB7 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPATA16Q9BXB7 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPATA16Q9BXB7 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPATA16Q9BXB7 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPATA16Q9BXB7 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SPATA16Q9BXB7 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SPATA16Q9BXB7 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPATA16Q9BXB7 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPATA16Q9BXB7 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPATA16Q9BXB7 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SPATA16Q9BXB7 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SPATA16Q9BXB7 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPATA16Q9BXB7 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPATA16Q9BXB7 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPATA16Q9BXB7 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPATA16Q9BXB7 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPATA16Q9BXB7 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPATA16Q9BXB7 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPATA16Q9BXB7 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPATA16Q9BXB7 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPATA16Q9BXB7 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPATA16Q9BXB7 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPATA16Q9BXB7 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPATA16Q9BXB7 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPATA16Q9BXB7 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPATA16Q9BXB7 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPATA16Q9BXB7 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPATA16Q9BXB7 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPATA16Q9BXB7 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPATA16Q9BXB7 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPATA16Q9BXB7 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPATA16Q9BXB7 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPATA16Q9BXB7 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPATA16Q9BXB7 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPATA16Q9BXB7 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPATA16Q9BXB7 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPATA16Q9BXB7 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPATA16Q9BXB7 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPATA16Q9BXB7 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPATA16Q9BXB7 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPATA16Q9BXB7 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPATA16Q9BXB7 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPATA16Q9BXB7 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPATA16Q9BXB7 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPATA16Q9BXB7 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPATA16Q9BXB7 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPATA16Q9BXB7 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPATA16Q9BXB7 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPATA16Q9BXB7 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPATA16Q9BXB7 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SPATA16Q9BXB7 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPATA16Q9BXB7 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPATA16Q9BXB7 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPATA16Q9BXB7 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPATA16Q9BXB7 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms