Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF4

TIMM29, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim29, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM29Q9BSF4 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms