Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ16

SPOCK3, Testican-3, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK3Q9BQ16 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SPOCK3Q9BQ16 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SPOCK3Q9BQ16 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SPOCK3Q9BQ16 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SPOCK3Q9BQ16 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SPOCK3Q9BQ16 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
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SPOCK3Q9BQ16 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SPOCK3Q9BQ16 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SPOCK3Q9BQ16 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
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SPOCK3Q9BQ16 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SPOCK3Q9BQ16 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SPOCK3Q9BQ16 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SPOCK3Q9BQ16 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC13.78□□□□□ -0.2
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SPOCK3Q9BQ16 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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SPOCK3Q9BQ16 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
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SPOCK3Q9BQ16 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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SPOCK3Q9BQ16 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SPOCK3Q9BQ16 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
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SPOCK3Q9BQ16 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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SPOCK3Q9BQ16 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SPOCK3Q9BQ16 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SPOCK3Q9BQ16 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SPOCK3Q9BQ16 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
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SPOCK3Q9BQ16 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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SPOCK3Q9BQ16 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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SPOCK3Q9BQ16 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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SPOCK3Q9BQ16 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SPOCK3Q9BQ16 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SPOCK3Q9BQ16 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SPOCK3Q9BQ16 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SPOCK3Q9BQ16 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SPOCK3Q9BQ16 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
SPOCK3Q9BQ16 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SPOCK3Q9BQ16 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
SPOCK3Q9BQ16 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SPOCK3Q9BQ16 STK40-201ENST00000359297 4837 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
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