Protein–RNA interactions for Protein: Q99081

TCF12, Transcription factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF12Q99081 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TCF12Q99081 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TCF12Q99081 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TCF12Q99081 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TCF12Q99081 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TCF12Q99081 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TCF12Q99081 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TCF12Q99081 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TCF12Q99081 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TCF12Q99081 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TCF12Q99081 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TCF12Q99081 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TCF12Q99081 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TCF12Q99081 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TCF12Q99081 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TCF12Q99081 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TCF12Q99081 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TCF12Q99081 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TCF12Q99081 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TCF12Q99081 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TCF12Q99081 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TCF12Q99081 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TCF12Q99081 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TCF12Q99081 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TCF12Q99081 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TCF12Q99081 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TCF12Q99081 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TCF12Q99081 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TCF12Q99081 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TCF12Q99081 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TCF12Q99081 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TCF12Q99081 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TCF12Q99081 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TCF12Q99081 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TCF12Q99081 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TCF12Q99081 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TCF12Q99081 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TCF12Q99081 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TCF12Q99081 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TCF12Q99081 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TCF12Q99081 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TCF12Q99081 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TCF12Q99081 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TCF12Q99081 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TCF12Q99081 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TCF12Q99081 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TCF12Q99081 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TCF12Q99081 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TCF12Q99081 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TCF12Q99081 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TCF12Q99081 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TCF12Q99081 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TCF12Q99081 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TCF12Q99081 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TCF12Q99081 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TCF12Q99081 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TCF12Q99081 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TCF12Q99081 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TCF12Q99081 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TCF12Q99081 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TCF12Q99081 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TCF12Q99081 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TCF12Q99081 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TCF12Q99081 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TCF12Q99081 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TCF12Q99081 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TCF12Q99081 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TCF12Q99081 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TCF12Q99081 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TCF12Q99081 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TCF12Q99081 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TCF12Q99081 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TCF12Q99081 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TCF12Q99081 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TCF12Q99081 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TCF12Q99081 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TCF12Q99081 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TCF12Q99081 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TCF12Q99081 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TCF12Q99081 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TCF12Q99081 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TCF12Q99081 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TCF12Q99081 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TCF12Q99081 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TCF12Q99081 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TCF12Q99081 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TCF12Q99081 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TCF12Q99081 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TCF12Q99081 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TCF12Q99081 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TCF12Q99081 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TCF12Q99081 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TCF12Q99081 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TCF12Q99081 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TCF12Q99081 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TCF12Q99081 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TCF12Q99081 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TCF12Q99081 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TCF12Q99081 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TCF12Q99081 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms