Protein–RNA interactions for Protein: Q96P64

AGAP4, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP4Q96P64 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
AGAP4Q96P64 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
AGAP4Q96P64 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
AGAP4Q96P64 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
AGAP4Q96P64 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
AGAP4Q96P64 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
AGAP4Q96P64 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
AGAP4Q96P64 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC15.06■□□□□ 0
AGAP4Q96P64 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
AGAP4Q96P64 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.06■□□□□ 0
AGAP4Q96P64 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AGAP4Q96P64 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AGAP4Q96P64 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AGAP4Q96P64 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
AGAP4Q96P64 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
AGAP4Q96P64 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.06■□□□□ 0
AGAP4Q96P64 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AGAP4Q96P64 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AGAP4Q96P64 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AGAP4Q96P64 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
AGAP4Q96P64 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AGAP4Q96P64 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
AGAP4Q96P64 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AGAP4Q96P64 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC15.06■□□□□ 0
AGAP4Q96P64 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
AGAP4Q96P64 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
AGAP4Q96P64 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
AGAP4Q96P64 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.05■□□□□ 0
AGAP4Q96P64 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
AGAP4Q96P64 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
AGAP4Q96P64 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
AGAP4Q96P64 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
AGAP4Q96P64 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
AGAP4Q96P64 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
AGAP4Q96P64 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
AGAP4Q96P64 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
AGAP4Q96P64 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
AGAP4Q96P64 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
AGAP4Q96P64 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
AGAP4Q96P64 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
AGAP4Q96P64 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
AGAP4Q96P64 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
AGAP4Q96P64 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
AGAP4Q96P64 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AGAP4Q96P64 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AGAP4Q96P64 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC15.05■□□□□ -0
AGAP4Q96P64 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
AGAP4Q96P64 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC15.05■□□□□ -0
AGAP4Q96P64 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
AGAP4Q96P64 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC15.05■□□□□ -0
AGAP4Q96P64 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
AGAP4Q96P64 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AGAP4Q96P64 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC15.05■□□□□ -0
AGAP4Q96P64 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
AGAP4Q96P64 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
AGAP4Q96P64 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
AGAP4Q96P64 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
AGAP4Q96P64 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC15.05■□□□□ -0
AGAP4Q96P64 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
AGAP4Q96P64 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
AGAP4Q96P64 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AGAP4Q96P64 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
AGAP4Q96P64 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AGAP4Q96P64 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
AGAP4Q96P64 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AGAP4Q96P64 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AGAP4Q96P64 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
AGAP4Q96P64 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AGAP4Q96P64 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
AGAP4Q96P64 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AGAP4Q96P64 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
AGAP4Q96P64 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AGAP4Q96P64 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
AGAP4Q96P64 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AGAP4Q96P64 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AGAP4Q96P64 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AGAP4Q96P64 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
AGAP4Q96P64 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AGAP4Q96P64 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AGAP4Q96P64 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AGAP4Q96P64 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.04■□□□□ -0
AGAP4Q96P64 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AGAP4Q96P64 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AGAP4Q96P64 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AGAP4Q96P64 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
AGAP4Q96P64 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AGAP4Q96P64 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
AGAP4Q96P64 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
AGAP4Q96P64 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
AGAP4Q96P64 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AGAP4Q96P64 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AGAP4Q96P64 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AGAP4Q96P64 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
AGAP4Q96P64 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
AGAP4Q96P64 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AGAP4Q96P64 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AGAP4Q96P64 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
AGAP4Q96P64 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
AGAP4Q96P64 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AGAP4Q96P64 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.4 ms