Protein–RNA interactions for Protein: Q96MU7

YTHDC1, YTH domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDC1Q96MU7 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
YTHDC1Q96MU7 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
YTHDC1Q96MU7 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
YTHDC1Q96MU7 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
YTHDC1Q96MU7 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
YTHDC1Q96MU7 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
YTHDC1Q96MU7 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
YTHDC1Q96MU7 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
YTHDC1Q96MU7 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
YTHDC1Q96MU7 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
YTHDC1Q96MU7 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
YTHDC1Q96MU7 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
YTHDC1Q96MU7 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
YTHDC1Q96MU7 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
YTHDC1Q96MU7 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
YTHDC1Q96MU7 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
YTHDC1Q96MU7 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
YTHDC1Q96MU7 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
YTHDC1Q96MU7 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
YTHDC1Q96MU7 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
YTHDC1Q96MU7 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
YTHDC1Q96MU7 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
YTHDC1Q96MU7 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
YTHDC1Q96MU7 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
YTHDC1Q96MU7 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
YTHDC1Q96MU7 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
YTHDC1Q96MU7 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
YTHDC1Q96MU7 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
YTHDC1Q96MU7 ZNF717-204ENST00000478296 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
YTHDC1Q96MU7 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
YTHDC1Q96MU7 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
YTHDC1Q96MU7 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
YTHDC1Q96MU7 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
YTHDC1Q96MU7 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
YTHDC1Q96MU7 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
YTHDC1Q96MU7 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
YTHDC1Q96MU7 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
YTHDC1Q96MU7 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
YTHDC1Q96MU7 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
YTHDC1Q96MU7 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
YTHDC1Q96MU7 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
YTHDC1Q96MU7 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
YTHDC1Q96MU7 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
YTHDC1Q96MU7 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
YTHDC1Q96MU7 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
YTHDC1Q96MU7 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
YTHDC1Q96MU7 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
YTHDC1Q96MU7 TNFRSF11A-205ENST00000616710 3809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
YTHDC1Q96MU7 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
YTHDC1Q96MU7 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
YTHDC1Q96MU7 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
YTHDC1Q96MU7 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
YTHDC1Q96MU7 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
YTHDC1Q96MU7 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
YTHDC1Q96MU7 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
YTHDC1Q96MU7 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
YTHDC1Q96MU7 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
YTHDC1Q96MU7 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
YTHDC1Q96MU7 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
YTHDC1Q96MU7 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
YTHDC1Q96MU7 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
YTHDC1Q96MU7 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
YTHDC1Q96MU7 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
YTHDC1Q96MU7 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
YTHDC1Q96MU7 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
YTHDC1Q96MU7 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
YTHDC1Q96MU7 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
YTHDC1Q96MU7 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
YTHDC1Q96MU7 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
YTHDC1Q96MU7 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
YTHDC1Q96MU7 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
YTHDC1Q96MU7 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
YTHDC1Q96MU7 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
YTHDC1Q96MU7 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
YTHDC1Q96MU7 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
YTHDC1Q96MU7 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
YTHDC1Q96MU7 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
YTHDC1Q96MU7 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
YTHDC1Q96MU7 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
YTHDC1Q96MU7 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
YTHDC1Q96MU7 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
YTHDC1Q96MU7 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
YTHDC1Q96MU7 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
YTHDC1Q96MU7 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
YTHDC1Q96MU7 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
YTHDC1Q96MU7 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
YTHDC1Q96MU7 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
YTHDC1Q96MU7 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
YTHDC1Q96MU7 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
YTHDC1Q96MU7 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
YTHDC1Q96MU7 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
YTHDC1Q96MU7 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
YTHDC1Q96MU7 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
YTHDC1Q96MU7 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
YTHDC1Q96MU7 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
YTHDC1Q96MU7 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
YTHDC1Q96MU7 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
YTHDC1Q96MU7 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
YTHDC1Q96MU7 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
YTHDC1Q96MU7 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms