Protein–RNA interactions for Protein: Q96GS4

BORCS6, BLOC-1-related complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BORCS6Q96GS4 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BORCS6Q96GS4 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BORCS6Q96GS4 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BORCS6Q96GS4 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BORCS6Q96GS4 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BORCS6Q96GS4 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BORCS6Q96GS4 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BORCS6Q96GS4 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BORCS6Q96GS4 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BORCS6Q96GS4 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BORCS6Q96GS4 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BORCS6Q96GS4 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BORCS6Q96GS4 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BORCS6Q96GS4 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BORCS6Q96GS4 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
BORCS6Q96GS4 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BORCS6Q96GS4 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BORCS6Q96GS4 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BORCS6Q96GS4 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BORCS6Q96GS4 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BORCS6Q96GS4 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BORCS6Q96GS4 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
BORCS6Q96GS4 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
BORCS6Q96GS4 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BORCS6Q96GS4 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BORCS6Q96GS4 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BORCS6Q96GS4 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BORCS6Q96GS4 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BORCS6Q96GS4 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BORCS6Q96GS4 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BORCS6Q96GS4 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BORCS6Q96GS4 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BORCS6Q96GS4 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BORCS6Q96GS4 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BORCS6Q96GS4 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BORCS6Q96GS4 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BORCS6Q96GS4 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BORCS6Q96GS4 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BORCS6Q96GS4 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BORCS6Q96GS4 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BORCS6Q96GS4 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BORCS6Q96GS4 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BORCS6Q96GS4 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BORCS6Q96GS4 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BORCS6Q96GS4 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BORCS6Q96GS4 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BORCS6Q96GS4 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BORCS6Q96GS4 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BORCS6Q96GS4 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BORCS6Q96GS4 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BORCS6Q96GS4 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BORCS6Q96GS4 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BORCS6Q96GS4 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BORCS6Q96GS4 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BORCS6Q96GS4 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BORCS6Q96GS4 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BORCS6Q96GS4 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
BORCS6Q96GS4 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BORCS6Q96GS4 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
BORCS6Q96GS4 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BORCS6Q96GS4 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BORCS6Q96GS4 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BORCS6Q96GS4 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
BORCS6Q96GS4 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BORCS6Q96GS4 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BORCS6Q96GS4 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
BORCS6Q96GS4 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BORCS6Q96GS4 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BORCS6Q96GS4 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BORCS6Q96GS4 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BORCS6Q96GS4 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BORCS6Q96GS4 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BORCS6Q96GS4 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BORCS6Q96GS4 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BORCS6Q96GS4 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BORCS6Q96GS4 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BORCS6Q96GS4 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BORCS6Q96GS4 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BORCS6Q96GS4 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BORCS6Q96GS4 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BORCS6Q96GS4 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BORCS6Q96GS4 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BORCS6Q96GS4 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BORCS6Q96GS4 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BORCS6Q96GS4 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BORCS6Q96GS4 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
BORCS6Q96GS4 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BORCS6Q96GS4 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BORCS6Q96GS4 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BORCS6Q96GS4 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BORCS6Q96GS4 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BORCS6Q96GS4 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BORCS6Q96GS4 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BORCS6Q96GS4 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BORCS6Q96GS4 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BORCS6Q96GS4 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BORCS6Q96GS4 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BORCS6Q96GS4 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BORCS6Q96GS4 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BORCS6Q96GS4 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.5 ms