Protein–RNA interactions for Protein: Q96DC8

ECHDC3, Enoyl-CoA hydratase domain-containing protein 3, mitochondrial, humanhuman

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Length 303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC3Q96DC8 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ECHDC3Q96DC8 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ECHDC3Q96DC8 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ECHDC3Q96DC8 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ECHDC3Q96DC8 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ECHDC3Q96DC8 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ECHDC3Q96DC8 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ECHDC3Q96DC8 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ECHDC3Q96DC8 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ECHDC3Q96DC8 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ECHDC3Q96DC8 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ECHDC3Q96DC8 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ECHDC3Q96DC8 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ECHDC3Q96DC8 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ECHDC3Q96DC8 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ECHDC3Q96DC8 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ECHDC3Q96DC8 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ECHDC3Q96DC8 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ECHDC3Q96DC8 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ECHDC3Q96DC8 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ECHDC3Q96DC8 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ECHDC3Q96DC8 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ECHDC3Q96DC8 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ECHDC3Q96DC8 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ECHDC3Q96DC8 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ECHDC3Q96DC8 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ECHDC3Q96DC8 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ECHDC3Q96DC8 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ECHDC3Q96DC8 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ECHDC3Q96DC8 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ECHDC3Q96DC8 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ECHDC3Q96DC8 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ECHDC3Q96DC8 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ECHDC3Q96DC8 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ECHDC3Q96DC8 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ECHDC3Q96DC8 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ECHDC3Q96DC8 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ECHDC3Q96DC8 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ECHDC3Q96DC8 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ECHDC3Q96DC8 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ECHDC3Q96DC8 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ECHDC3Q96DC8 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ECHDC3Q96DC8 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ECHDC3Q96DC8 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ECHDC3Q96DC8 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ECHDC3Q96DC8 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ECHDC3Q96DC8 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ECHDC3Q96DC8 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ECHDC3Q96DC8 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ECHDC3Q96DC8 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ECHDC3Q96DC8 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ECHDC3Q96DC8 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ECHDC3Q96DC8 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ECHDC3Q96DC8 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ECHDC3Q96DC8 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ECHDC3Q96DC8 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ECHDC3Q96DC8 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ECHDC3Q96DC8 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ECHDC3Q96DC8 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ECHDC3Q96DC8 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ECHDC3Q96DC8 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ECHDC3Q96DC8 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ECHDC3Q96DC8 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ECHDC3Q96DC8 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ECHDC3Q96DC8 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ECHDC3Q96DC8 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ECHDC3Q96DC8 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ECHDC3Q96DC8 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ECHDC3Q96DC8 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ECHDC3Q96DC8 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ECHDC3Q96DC8 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ECHDC3Q96DC8 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ECHDC3Q96DC8 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ECHDC3Q96DC8 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ECHDC3Q96DC8 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ECHDC3Q96DC8 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ECHDC3Q96DC8 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ECHDC3Q96DC8 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ECHDC3Q96DC8 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ECHDC3Q96DC8 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ECHDC3Q96DC8 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ECHDC3Q96DC8 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ECHDC3Q96DC8 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ECHDC3Q96DC8 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ECHDC3Q96DC8 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ECHDC3Q96DC8 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ECHDC3Q96DC8 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ECHDC3Q96DC8 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ECHDC3Q96DC8 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ECHDC3Q96DC8 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ECHDC3Q96DC8 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ECHDC3Q96DC8 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ECHDC3Q96DC8 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ECHDC3Q96DC8 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ECHDC3Q96DC8 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ECHDC3Q96DC8 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ECHDC3Q96DC8 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ECHDC3Q96DC8 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ECHDC3Q96DC8 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ECHDC3Q96DC8 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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