Protein–RNA interactions for Protein: Q969G5

CAVIN3, Caveolae-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN3Q969G5 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CAVIN3Q969G5 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CAVIN3Q969G5 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CAVIN3Q969G5 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CAVIN3Q969G5 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CAVIN3Q969G5 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CAVIN3Q969G5 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CAVIN3Q969G5 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CAVIN3Q969G5 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CAVIN3Q969G5 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CAVIN3Q969G5 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CAVIN3Q969G5 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CAVIN3Q969G5 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CAVIN3Q969G5 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CAVIN3Q969G5 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CAVIN3Q969G5 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CAVIN3Q969G5 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CAVIN3Q969G5 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CAVIN3Q969G5 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CAVIN3Q969G5 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CAVIN3Q969G5 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CAVIN3Q969G5 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CAVIN3Q969G5 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CAVIN3Q969G5 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CAVIN3Q969G5 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CAVIN3Q969G5 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CAVIN3Q969G5 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CAVIN3Q969G5 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CAVIN3Q969G5 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CAVIN3Q969G5 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CAVIN3Q969G5 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CAVIN3Q969G5 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CAVIN3Q969G5 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CAVIN3Q969G5 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CAVIN3Q969G5 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CAVIN3Q969G5 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CAVIN3Q969G5 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CAVIN3Q969G5 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CAVIN3Q969G5 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CAVIN3Q969G5 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CAVIN3Q969G5 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CAVIN3Q969G5 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CAVIN3Q969G5 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CAVIN3Q969G5 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CAVIN3Q969G5 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CAVIN3Q969G5 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CAVIN3Q969G5 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CAVIN3Q969G5 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CAVIN3Q969G5 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CAVIN3Q969G5 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CAVIN3Q969G5 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CAVIN3Q969G5 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CAVIN3Q969G5 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CAVIN3Q969G5 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CAVIN3Q969G5 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CAVIN3Q969G5 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CAVIN3Q969G5 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CAVIN3Q969G5 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CAVIN3Q969G5 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CAVIN3Q969G5 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CAVIN3Q969G5 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CAVIN3Q969G5 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CAVIN3Q969G5 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CAVIN3Q969G5 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CAVIN3Q969G5 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CAVIN3Q969G5 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CAVIN3Q969G5 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CAVIN3Q969G5 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CAVIN3Q969G5 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CAVIN3Q969G5 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CAVIN3Q969G5 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CAVIN3Q969G5 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CAVIN3Q969G5 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CAVIN3Q969G5 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CAVIN3Q969G5 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CAVIN3Q969G5 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CAVIN3Q969G5 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CAVIN3Q969G5 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CAVIN3Q969G5 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CAVIN3Q969G5 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CAVIN3Q969G5 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CAVIN3Q969G5 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CAVIN3Q969G5 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CAVIN3Q969G5 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CAVIN3Q969G5 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CAVIN3Q969G5 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CAVIN3Q969G5 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CAVIN3Q969G5 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CAVIN3Q969G5 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CAVIN3Q969G5 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CAVIN3Q969G5 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CAVIN3Q969G5 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CAVIN3Q969G5 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CAVIN3Q969G5 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CAVIN3Q969G5 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CAVIN3Q969G5 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CAVIN3Q969G5 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CAVIN3Q969G5 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CAVIN3Q969G5 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CAVIN3Q969G5 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms