Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHH9

ATL2, Atlastin-2, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL2Q8NHH9 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms