Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEV1

CSNK2A3, Casein kinase II subunit alpha 3, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A3Q8NEV1 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
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CSNK2A3Q8NEV1 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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