Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6U2

LINC00612, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00612, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00612Q8N6U2 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.09□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC11.09□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC11.08□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms