Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSB3

LINC00299, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00299, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00299Q6ZSB3 KDELR1-201ENST00000330720 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 ACADM-218ENST00000541113 2535 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 BEND7-201ENST00000341083 2239 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 C7orf57-202ENST00000420324 1957 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 LINC01725-203ENST00000417975 3177 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 PIK3R5-216ENST00000584803 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 SLC22A23-202ENST00000380302 2883 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 BAK1-202ENST00000374467 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC13.84□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 RPS6KA1-213ENST00000526792 2596 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 BEND3P3-201ENST00000611030 2440 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.6 ms