Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZP82

CCDC141, Coiled-coil domain-containing protein 141, humanhuman

Predictions only

Length 1,450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC141Q6ZP82 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC141Q6ZP82 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC141Q6ZP82 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC141Q6ZP82 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC141Q6ZP82 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC141Q6ZP82 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC141Q6ZP82 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC141Q6ZP82 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC141Q6ZP82 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC141Q6ZP82 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC141Q6ZP82 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC141Q6ZP82 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC141Q6ZP82 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC141Q6ZP82 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC141Q6ZP82 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC141Q6ZP82 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC141Q6ZP82 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC141Q6ZP82 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC141Q6ZP82 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC141Q6ZP82 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC141Q6ZP82 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC141Q6ZP82 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC141Q6ZP82 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC141Q6ZP82 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC141Q6ZP82 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC141Q6ZP82 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC141Q6ZP82 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC141Q6ZP82 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC141Q6ZP82 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC141Q6ZP82 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC141Q6ZP82 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC141Q6ZP82 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC141Q6ZP82 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC141Q6ZP82 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC141Q6ZP82 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC141Q6ZP82 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC141Q6ZP82 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC141Q6ZP82 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC141Q6ZP82 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC141Q6ZP82 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC141Q6ZP82 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC141Q6ZP82 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC141Q6ZP82 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC141Q6ZP82 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC141Q6ZP82 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC141Q6ZP82 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC141Q6ZP82 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC141Q6ZP82 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC141Q6ZP82 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC141Q6ZP82 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC141Q6ZP82 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC141Q6ZP82 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC141Q6ZP82 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC141Q6ZP82 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC141Q6ZP82 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC141Q6ZP82 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC141Q6ZP82 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC141Q6ZP82 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC141Q6ZP82 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC141Q6ZP82 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC141Q6ZP82 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC141Q6ZP82 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC141Q6ZP82 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC141Q6ZP82 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC141Q6ZP82 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC141Q6ZP82 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC141Q6ZP82 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC141Q6ZP82 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC141Q6ZP82 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC141Q6ZP82 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC141Q6ZP82 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC141Q6ZP82 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC141Q6ZP82 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC141Q6ZP82 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC141Q6ZP82 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC141Q6ZP82 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC141Q6ZP82 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC141Q6ZP82 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC141Q6ZP82 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC141Q6ZP82 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC141Q6ZP82 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC141Q6ZP82 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC141Q6ZP82 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC141Q6ZP82 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC141Q6ZP82 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC141Q6ZP82 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC141Q6ZP82 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC141Q6ZP82 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC141Q6ZP82 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC141Q6ZP82 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC141Q6ZP82 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC141Q6ZP82 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC141Q6ZP82 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC141Q6ZP82 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC141Q6ZP82 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC141Q6ZP82 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC141Q6ZP82 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC141Q6ZP82 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC141Q6ZP82 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC141Q6ZP82 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms