Protein–RNA interactions for Protein: Q6KB66

KRT80, Keratin, type II cytoskeletal 80, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT80Q6KB66 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KRT80Q6KB66 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
KRT80Q6KB66 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KRT80Q6KB66 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KRT80Q6KB66 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KRT80Q6KB66 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KRT80Q6KB66 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KRT80Q6KB66 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KRT80Q6KB66 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KRT80Q6KB66 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KRT80Q6KB66 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KRT80Q6KB66 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KRT80Q6KB66 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KRT80Q6KB66 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KRT80Q6KB66 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KRT80Q6KB66 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KRT80Q6KB66 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
KRT80Q6KB66 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
KRT80Q6KB66 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
KRT80Q6KB66 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KRT80Q6KB66 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
KRT80Q6KB66 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KRT80Q6KB66 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KRT80Q6KB66 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
KRT80Q6KB66 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KRT80Q6KB66 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KRT80Q6KB66 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KRT80Q6KB66 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KRT80Q6KB66 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KRT80Q6KB66 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KRT80Q6KB66 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KRT80Q6KB66 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KRT80Q6KB66 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KRT80Q6KB66 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KRT80Q6KB66 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KRT80Q6KB66 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KRT80Q6KB66 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KRT80Q6KB66 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KRT80Q6KB66 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
KRT80Q6KB66 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KRT80Q6KB66 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KRT80Q6KB66 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KRT80Q6KB66 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KRT80Q6KB66 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KRT80Q6KB66 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KRT80Q6KB66 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KRT80Q6KB66 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KRT80Q6KB66 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KRT80Q6KB66 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KRT80Q6KB66 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KRT80Q6KB66 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KRT80Q6KB66 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KRT80Q6KB66 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KRT80Q6KB66 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KRT80Q6KB66 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KRT80Q6KB66 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KRT80Q6KB66 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KRT80Q6KB66 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
KRT80Q6KB66 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KRT80Q6KB66 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KRT80Q6KB66 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KRT80Q6KB66 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
KRT80Q6KB66 GRM1-203ENST00000361719 6754 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KRT80Q6KB66 DNAJC27-207ENST00000534855 4831 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KRT80Q6KB66 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KRT80Q6KB66 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KRT80Q6KB66 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KRT80Q6KB66 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KRT80Q6KB66 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KRT80Q6KB66 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KRT80Q6KB66 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KRT80Q6KB66 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KRT80Q6KB66 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KRT80Q6KB66 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KRT80Q6KB66 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KRT80Q6KB66 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KRT80Q6KB66 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KRT80Q6KB66 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KRT80Q6KB66 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KRT80Q6KB66 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KRT80Q6KB66 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KRT80Q6KB66 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KRT80Q6KB66 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KRT80Q6KB66 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KRT80Q6KB66 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KRT80Q6KB66 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KRT80Q6KB66 RBFADN-204ENST00000568911 5187 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KRT80Q6KB66 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KRT80Q6KB66 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KRT80Q6KB66 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KRT80Q6KB66 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KRT80Q6KB66 AC005324.3-201ENST00000455584 5514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KRT80Q6KB66 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KRT80Q6KB66 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KRT80Q6KB66 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KRT80Q6KB66 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KRT80Q6KB66 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KRT80Q6KB66 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
KRT80Q6KB66 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KRT80Q6KB66 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.7 ms