Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW79

CEP170, Centrosomal protein of 170 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP170Q5SW79 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CEP170Q5SW79 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CEP170Q5SW79 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CEP170Q5SW79 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CEP170Q5SW79 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CEP170Q5SW79 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CEP170Q5SW79 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CEP170Q5SW79 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CEP170Q5SW79 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CEP170Q5SW79 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CEP170Q5SW79 AC116609.2-201ENST00000431542 256 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CEP170Q5SW79 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CEP170Q5SW79 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CEP170Q5SW79 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CEP170Q5SW79 CRTC3-AS1-202ENST00000559531 657 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CEP170Q5SW79 AC006435.2-201ENST00000574290 846 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CEP170Q5SW79 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CEP170Q5SW79 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CEP170Q5SW79 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CEP170Q5SW79 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CEP170Q5SW79 NTF3-202ENST00000423158 1336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CEP170Q5SW79 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CEP170Q5SW79 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CEP170Q5SW79 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CEP170Q5SW79 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CEP170Q5SW79 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CEP170Q5SW79 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CEP170Q5SW79 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CEP170Q5SW79 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CEP170Q5SW79 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CEP170Q5SW79 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CEP170Q5SW79 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CEP170Q5SW79 MIR1227-201ENST00000408484 88 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CEP170Q5SW79 ZFAND2B-205ENST00000409319 771 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CEP170Q5SW79 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CEP170Q5SW79 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CEP170Q5SW79 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CEP170Q5SW79 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CEP170Q5SW79 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CEP170Q5SW79 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CEP170Q5SW79 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CEP170Q5SW79 SRSF3-208ENST00000620941 869 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CEP170Q5SW79 LINC00969-257ENST00000625632 898 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CEP170Q5SW79 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CEP170Q5SW79 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CEP170Q5SW79 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CEP170Q5SW79 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CEP170Q5SW79 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CEP170Q5SW79 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CEP170Q5SW79 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CEP170Q5SW79 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CEP170Q5SW79 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CEP170Q5SW79 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CEP170Q5SW79 CHCHD2-201ENST00000395422 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CEP170Q5SW79 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CEP170Q5SW79 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CEP170Q5SW79 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CEP170Q5SW79 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CEP170Q5SW79 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CEP170Q5SW79 AC009084.3-201ENST00000623356 437 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CEP170Q5SW79 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CEP170Q5SW79 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CEP170Q5SW79 AC025271.4-201ENST00000621477 1726 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CEP170Q5SW79 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CEP170Q5SW79 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CEP170Q5SW79 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CEP170Q5SW79 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CEP170Q5SW79 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CEP170Q5SW79 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CEP170Q5SW79 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CEP170Q5SW79 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CEP170Q5SW79 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CEP170Q5SW79 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CEP170Q5SW79 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CEP170Q5SW79 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CEP170Q5SW79 AC127024.7-201ENST00000625101 200 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CEP170Q5SW79 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CEP170Q5SW79 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CEP170Q5SW79 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CEP170Q5SW79 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CEP170Q5SW79 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CEP170Q5SW79 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CEP170Q5SW79 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CEP170Q5SW79 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CEP170Q5SW79 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CEP170Q5SW79 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CEP170Q5SW79 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CEP170Q5SW79 PPOX-204ENST00000462866 473 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CEP170Q5SW79 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CEP170Q5SW79 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CEP170Q5SW79 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CEP170Q5SW79 FOS-204ENST00000554617 796 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CEP170Q5SW79 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CEP170Q5SW79 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CEP170Q5SW79 PLIN5-202ENST00000586133 907 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CEP170Q5SW79 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CEP170Q5SW79 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CEP170Q5SW79 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CEP170Q5SW79 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CEP170Q5SW79 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70 ms