Protein–RNA interactions for Protein: Q495C1

RNF212, Probable E3 SUMO-protein ligase RNF212, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF212Q495C1 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF212Q495C1 SEPT6-201ENST00000343984 2693 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF212Q495C1 FUT3-201ENST00000303225 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF212Q495C1 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF212Q495C1 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RNF212Q495C1 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RNF212Q495C1 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RNF212Q495C1 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RNF212Q495C1 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RNF212Q495C1 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RNF212Q495C1 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RNF212Q495C1 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RNF212Q495C1 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RNF212Q495C1 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
RNF212Q495C1 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RNF212Q495C1 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RNF212Q495C1 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RNF212Q495C1 PCDHA2-202ENST00000520672 3056 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RNF212Q495C1 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RNF212Q495C1 FAAP100-202ENST00000425898 2996 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RNF212Q495C1 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RNF212Q495C1 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RNF212Q495C1 PCM1-202ENST00000327578 8287 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RNF212Q495C1 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RNF212Q495C1 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RNF212Q495C1 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RNF212Q495C1 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RNF212Q495C1 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RNF212Q495C1 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
RNF212Q495C1 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RNF212Q495C1 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RNF212Q495C1 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RNF212Q495C1 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
RNF212Q495C1 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RNF212Q495C1 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RNF212Q495C1 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RNF212Q495C1 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RNF212Q495C1 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RNF212Q495C1 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RNF212Q495C1 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RNF212Q495C1 OTP-201ENST00000306422 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RNF212Q495C1 TMUB2-201ENST00000319511 2418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RNF212Q495C1 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RNF212Q495C1 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RNF212Q495C1 SENP3-202ENST00000429205 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RNF212Q495C1 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RNF212Q495C1 CPA5-205ENST00000466363 2099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RNF212Q495C1 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RNF212Q495C1 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RNF212Q495C1 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RNF212Q495C1 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RNF212Q495C1 NEFH-201ENST00000310624 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RNF212Q495C1 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RNF212Q495C1 IGHG3-202ENST00000641136 2751 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RNF212Q495C1 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RNF212Q495C1 STAB1-201ENST00000321725 7928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RNF212Q495C1 SFI1-229ENST00000540643 4226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
RNF212Q495C1 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
RNF212Q495C1 MOB3C-203ENST00000371940 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RNF212Q495C1 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RNF212Q495C1 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
RNF212Q495C1 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
RNF212Q495C1 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
RNF212Q495C1 PHLDB2-204ENST00000431670 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RNF212Q495C1 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RNF212Q495C1 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RNF212Q495C1 LPO-201ENST00000262290 2979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RNF212Q495C1 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
RNF212Q495C1 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RNF212Q495C1 PROKR1-201ENST00000303786 4273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
RNF212Q495C1 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
RNF212Q495C1 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RNF212Q495C1 OFD1-202ENST00000380550 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RNF212Q495C1 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RNF212Q495C1 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RNF212Q495C1 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RNF212Q495C1 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RNF212Q495C1 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RNF212Q495C1 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
RNF212Q495C1 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RNF212Q495C1 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
RNF212Q495C1 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RNF212Q495C1 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
RNF212Q495C1 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RNF212Q495C1 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RNF212Q495C1 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
RNF212Q495C1 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
RNF212Q495C1 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC12.73□□□□□ -0.37
RNF212Q495C1 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
RNF212Q495C1 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
RNF212Q495C1 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
RNF212Q495C1 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RNF212Q495C1 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
RNF212Q495C1 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
RNF212Q495C1 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
RNF212Q495C1 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RNF212Q495C1 SMARCA4-202ENST00000413806 5512 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
RNF212Q495C1 PRRT2-201ENST00000300797 3002 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
RNF212Q495C1 EPHB3-201ENST00000330394 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RNF212Q495C1 MEGF8-201ENST00000251268 9549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms