Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
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