Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXZ7

TTLL9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL9Q3SXZ7 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TTLL9Q3SXZ7 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TTLL9Q3SXZ7 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TTLL9Q3SXZ7 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TTLL9Q3SXZ7 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TTLL9Q3SXZ7 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TTLL9Q3SXZ7 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TTLL9Q3SXZ7 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TTLL9Q3SXZ7 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TTLL9Q3SXZ7 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TTLL9Q3SXZ7 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TTLL9Q3SXZ7 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TTLL9Q3SXZ7 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TTLL9Q3SXZ7 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TTLL9Q3SXZ7 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TTLL9Q3SXZ7 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TTLL9Q3SXZ7 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TTLL9Q3SXZ7 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TTLL9Q3SXZ7 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TTLL9Q3SXZ7 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TTLL9Q3SXZ7 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TTLL9Q3SXZ7 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TTLL9Q3SXZ7 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TTLL9Q3SXZ7 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TTLL9Q3SXZ7 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TTLL9Q3SXZ7 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TTLL9Q3SXZ7 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TTLL9Q3SXZ7 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TTLL9Q3SXZ7 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TTLL9Q3SXZ7 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TTLL9Q3SXZ7 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TTLL9Q3SXZ7 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TTLL9Q3SXZ7 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TTLL9Q3SXZ7 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TTLL9Q3SXZ7 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TTLL9Q3SXZ7 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TTLL9Q3SXZ7 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TTLL9Q3SXZ7 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TTLL9Q3SXZ7 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TTLL9Q3SXZ7 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TTLL9Q3SXZ7 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TTLL9Q3SXZ7 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TTLL9Q3SXZ7 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TTLL9Q3SXZ7 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TTLL9Q3SXZ7 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TTLL9Q3SXZ7 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TTLL9Q3SXZ7 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TTLL9Q3SXZ7 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TTLL9Q3SXZ7 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TTLL9Q3SXZ7 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TTLL9Q3SXZ7 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TTLL9Q3SXZ7 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TTLL9Q3SXZ7 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TTLL9Q3SXZ7 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TTLL9Q3SXZ7 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TTLL9Q3SXZ7 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TTLL9Q3SXZ7 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TTLL9Q3SXZ7 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TTLL9Q3SXZ7 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TTLL9Q3SXZ7 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TTLL9Q3SXZ7 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TTLL9Q3SXZ7 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TTLL9Q3SXZ7 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TTLL9Q3SXZ7 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TTLL9Q3SXZ7 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TTLL9Q3SXZ7 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TTLL9Q3SXZ7 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TTLL9Q3SXZ7 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TTLL9Q3SXZ7 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TTLL9Q3SXZ7 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TTLL9Q3SXZ7 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TTLL9Q3SXZ7 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TTLL9Q3SXZ7 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TTLL9Q3SXZ7 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TTLL9Q3SXZ7 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TTLL9Q3SXZ7 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TTLL9Q3SXZ7 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TTLL9Q3SXZ7 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TTLL9Q3SXZ7 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TTLL9Q3SXZ7 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TTLL9Q3SXZ7 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TTLL9Q3SXZ7 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TTLL9Q3SXZ7 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TTLL9Q3SXZ7 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TTLL9Q3SXZ7 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TTLL9Q3SXZ7 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TTLL9Q3SXZ7 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TTLL9Q3SXZ7 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TTLL9Q3SXZ7 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TTLL9Q3SXZ7 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TTLL9Q3SXZ7 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TTLL9Q3SXZ7 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TTLL9Q3SXZ7 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TTLL9Q3SXZ7 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TTLL9Q3SXZ7 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TTLL9Q3SXZ7 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TTLL9Q3SXZ7 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TTLL9Q3SXZ7 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TTLL9Q3SXZ7 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TTLL9Q3SXZ7 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms