Protein–RNA interactions for Protein: Q2WGJ6

KLHL38, Kelch-like protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL38Q2WGJ6 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL38Q2WGJ6 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL38Q2WGJ6 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL38Q2WGJ6 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL38Q2WGJ6 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL38Q2WGJ6 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL38Q2WGJ6 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL38Q2WGJ6 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL38Q2WGJ6 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL38Q2WGJ6 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL38Q2WGJ6 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL38Q2WGJ6 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL38Q2WGJ6 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL38Q2WGJ6 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL38Q2WGJ6 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL38Q2WGJ6 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL38Q2WGJ6 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL38Q2WGJ6 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL38Q2WGJ6 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL38Q2WGJ6 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL38Q2WGJ6 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL38Q2WGJ6 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL38Q2WGJ6 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL38Q2WGJ6 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL38Q2WGJ6 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL38Q2WGJ6 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL38Q2WGJ6 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL38Q2WGJ6 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL38Q2WGJ6 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL38Q2WGJ6 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL38Q2WGJ6 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL38Q2WGJ6 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL38Q2WGJ6 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL38Q2WGJ6 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL38Q2WGJ6 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL38Q2WGJ6 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL38Q2WGJ6 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL38Q2WGJ6 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL38Q2WGJ6 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL38Q2WGJ6 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL38Q2WGJ6 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL38Q2WGJ6 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL38Q2WGJ6 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL38Q2WGJ6 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL38Q2WGJ6 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL38Q2WGJ6 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL38Q2WGJ6 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL38Q2WGJ6 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL38Q2WGJ6 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL38Q2WGJ6 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL38Q2WGJ6 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL38Q2WGJ6 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL38Q2WGJ6 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL38Q2WGJ6 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL38Q2WGJ6 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL38Q2WGJ6 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL38Q2WGJ6 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL38Q2WGJ6 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL38Q2WGJ6 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL38Q2WGJ6 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL38Q2WGJ6 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL38Q2WGJ6 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL38Q2WGJ6 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
KLHL38Q2WGJ6 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
KLHL38Q2WGJ6 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
KLHL38Q2WGJ6 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
KLHL38Q2WGJ6 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms