Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBA0

KLHL40, Kelch-like protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL40Q2TBA0 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL40Q2TBA0 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL40Q2TBA0 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL40Q2TBA0 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL40Q2TBA0 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL40Q2TBA0 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL40Q2TBA0 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL40Q2TBA0 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL40Q2TBA0 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL40Q2TBA0 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL40Q2TBA0 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL40Q2TBA0 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL40Q2TBA0 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL40Q2TBA0 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL40Q2TBA0 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL40Q2TBA0 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL40Q2TBA0 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL40Q2TBA0 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL40Q2TBA0 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL40Q2TBA0 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL40Q2TBA0 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL40Q2TBA0 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL40Q2TBA0 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL40Q2TBA0 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL40Q2TBA0 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL40Q2TBA0 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL40Q2TBA0 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL40Q2TBA0 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL40Q2TBA0 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL40Q2TBA0 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL40Q2TBA0 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL40Q2TBA0 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL40Q2TBA0 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL40Q2TBA0 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL40Q2TBA0 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL40Q2TBA0 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL40Q2TBA0 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL40Q2TBA0 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL40Q2TBA0 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL40Q2TBA0 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL40Q2TBA0 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL40Q2TBA0 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL40Q2TBA0 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL40Q2TBA0 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL40Q2TBA0 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL40Q2TBA0 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL40Q2TBA0 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL40Q2TBA0 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL40Q2TBA0 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL40Q2TBA0 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL40Q2TBA0 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL40Q2TBA0 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL40Q2TBA0 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL40Q2TBA0 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL40Q2TBA0 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL40Q2TBA0 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL40Q2TBA0 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL40Q2TBA0 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL40Q2TBA0 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL40Q2TBA0 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL40Q2TBA0 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL40Q2TBA0 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL40Q2TBA0 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL40Q2TBA0 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL40Q2TBA0 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL40Q2TBA0 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL40Q2TBA0 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL40Q2TBA0 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL40Q2TBA0 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL40Q2TBA0 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL40Q2TBA0 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL40Q2TBA0 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL40Q2TBA0 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL40Q2TBA0 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL40Q2TBA0 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL40Q2TBA0 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL40Q2TBA0 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL40Q2TBA0 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL40Q2TBA0 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL40Q2TBA0 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL40Q2TBA0 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL40Q2TBA0 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL40Q2TBA0 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL40Q2TBA0 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL40Q2TBA0 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL40Q2TBA0 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL40Q2TBA0 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL40Q2TBA0 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL40Q2TBA0 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL40Q2TBA0 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL40Q2TBA0 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL40Q2TBA0 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL40Q2TBA0 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL40Q2TBA0 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL40Q2TBA0 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL40Q2TBA0 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL40Q2TBA0 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL40Q2TBA0 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL40Q2TBA0 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL40Q2TBA0 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63 ms