Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms