Protein–RNA interactions for Protein: Q15286

RAB35, Ras-related protein Rab-35, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB35Q15286 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
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RAB35Q15286 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RAB35Q15286 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
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RAB35Q15286 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RAB35Q15286 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RAB35Q15286 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RAB35Q15286 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RAB35Q15286 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RAB35Q15286 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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