Protein–RNA interactions for Protein: Q15004

PCLAF, PCNA-associated factor, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCLAFQ15004 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCLAFQ15004 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PCLAFQ15004 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PCLAFQ15004 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCLAFQ15004 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCLAFQ15004 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PCLAFQ15004 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PCLAFQ15004 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCLAFQ15004 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PCLAFQ15004 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCLAFQ15004 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCLAFQ15004 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCLAFQ15004 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCLAFQ15004 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCLAFQ15004 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PCLAFQ15004 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PCLAFQ15004 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCLAFQ15004 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCLAFQ15004 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCLAFQ15004 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCLAFQ15004 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCLAFQ15004 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCLAFQ15004 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCLAFQ15004 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PCLAFQ15004 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PCLAFQ15004 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCLAFQ15004 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCLAFQ15004 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCLAFQ15004 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCLAFQ15004 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCLAFQ15004 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCLAFQ15004 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCLAFQ15004 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCLAFQ15004 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCLAFQ15004 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCLAFQ15004 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCLAFQ15004 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCLAFQ15004 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCLAFQ15004 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCLAFQ15004 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCLAFQ15004 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCLAFQ15004 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCLAFQ15004 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCLAFQ15004 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCLAFQ15004 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCLAFQ15004 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCLAFQ15004 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCLAFQ15004 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCLAFQ15004 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCLAFQ15004 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCLAFQ15004 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCLAFQ15004 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCLAFQ15004 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PCLAFQ15004 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCLAFQ15004 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCLAFQ15004 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PCLAFQ15004 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCLAFQ15004 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCLAFQ15004 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCLAFQ15004 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCLAFQ15004 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCLAFQ15004 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCLAFQ15004 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCLAFQ15004 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCLAFQ15004 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCLAFQ15004 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCLAFQ15004 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCLAFQ15004 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCLAFQ15004 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCLAFQ15004 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCLAFQ15004 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCLAFQ15004 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCLAFQ15004 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCLAFQ15004 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCLAFQ15004 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCLAFQ15004 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCLAFQ15004 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCLAFQ15004 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCLAFQ15004 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCLAFQ15004 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCLAFQ15004 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PCLAFQ15004 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCLAFQ15004 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCLAFQ15004 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCLAFQ15004 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCLAFQ15004 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCLAFQ15004 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCLAFQ15004 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCLAFQ15004 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCLAFQ15004 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PCLAFQ15004 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCLAFQ15004 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCLAFQ15004 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCLAFQ15004 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCLAFQ15004 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCLAFQ15004 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCLAFQ15004 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCLAFQ15004 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCLAFQ15004 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCLAFQ15004 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms