Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NCAPHQ15003 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NCAPHQ15003 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NCAPHQ15003 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NCAPHQ15003 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NCAPHQ15003 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NCAPHQ15003 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NCAPHQ15003 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NCAPHQ15003 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NCAPHQ15003 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NCAPHQ15003 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NCAPHQ15003 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NCAPHQ15003 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NCAPHQ15003 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NCAPHQ15003 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NCAPHQ15003 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NCAPHQ15003 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NCAPHQ15003 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NCAPHQ15003 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
NCAPHQ15003 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NCAPHQ15003 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
NCAPHQ15003 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
NCAPHQ15003 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NCAPHQ15003 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NCAPHQ15003 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NCAPHQ15003 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NCAPHQ15003 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NCAPHQ15003 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NCAPHQ15003 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NCAPHQ15003 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NCAPHQ15003 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NCAPHQ15003 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NCAPHQ15003 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NCAPHQ15003 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NCAPHQ15003 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NCAPHQ15003 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NCAPHQ15003 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NCAPHQ15003 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NCAPHQ15003 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NCAPHQ15003 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NCAPHQ15003 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NCAPHQ15003 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NCAPHQ15003 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NCAPHQ15003 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NCAPHQ15003 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NCAPHQ15003 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NCAPHQ15003 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NCAPHQ15003 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NCAPHQ15003 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NCAPHQ15003 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NCAPHQ15003 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NCAPHQ15003 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NCAPHQ15003 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NCAPHQ15003 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
NCAPHQ15003 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NCAPHQ15003 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NCAPHQ15003 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
NCAPHQ15003 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NCAPHQ15003 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NCAPHQ15003 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NCAPHQ15003 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NCAPHQ15003 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NCAPHQ15003 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NCAPHQ15003 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NCAPHQ15003 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NCAPHQ15003 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NCAPHQ15003 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NCAPHQ15003 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NCAPHQ15003 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NCAPHQ15003 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
NCAPHQ15003 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NCAPHQ15003 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NCAPHQ15003 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NCAPHQ15003 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NCAPHQ15003 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NCAPHQ15003 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NCAPHQ15003 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NCAPHQ15003 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NCAPHQ15003 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NCAPHQ15003 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NCAPHQ15003 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NCAPHQ15003 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NCAPHQ15003 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NCAPHQ15003 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NCAPHQ15003 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NCAPHQ15003 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NCAPHQ15003 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NCAPHQ15003 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NCAPHQ15003 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NCAPHQ15003 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NCAPHQ15003 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NCAPHQ15003 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
NCAPHQ15003 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NCAPHQ15003 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NCAPHQ15003 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
NCAPHQ15003 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
NCAPHQ15003 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NCAPHQ15003 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NCAPHQ15003 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NCAPHQ15003 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms