Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
COL19A1Q14993 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
COL19A1Q14993 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COL19A1Q14993 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COL19A1Q14993 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COL19A1Q14993 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COL19A1Q14993 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COL19A1Q14993 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
COL19A1Q14993 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
COL19A1Q14993 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COL19A1Q14993 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
COL19A1Q14993 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
COL19A1Q14993 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
COL19A1Q14993 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
COL19A1Q14993 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
COL19A1Q14993 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
COL19A1Q14993 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
COL19A1Q14993 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
COL19A1Q14993 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
COL19A1Q14993 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
COL19A1Q14993 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
COL19A1Q14993 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
COL19A1Q14993 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
COL19A1Q14993 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COL19A1Q14993 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
COL19A1Q14993 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COL19A1Q14993 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COL19A1Q14993 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COL19A1Q14993 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COL19A1Q14993 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
COL19A1Q14993 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COL19A1Q14993 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COL19A1Q14993 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COL19A1Q14993 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
COL19A1Q14993 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COL19A1Q14993 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COL19A1Q14993 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COL19A1Q14993 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COL19A1Q14993 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COL19A1Q14993 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COL19A1Q14993 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
COL19A1Q14993 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
COL19A1Q14993 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COL19A1Q14993 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COL19A1Q14993 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
COL19A1Q14993 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COL19A1Q14993 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
COL19A1Q14993 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COL19A1Q14993 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
COL19A1Q14993 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
COL19A1Q14993 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
COL19A1Q14993 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
COL19A1Q14993 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
COL19A1Q14993 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
COL19A1Q14993 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
COL19A1Q14993 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COL19A1Q14993 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COL19A1Q14993 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
COL19A1Q14993 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
COL19A1Q14993 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
COL19A1Q14993 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COL19A1Q14993 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COL19A1Q14993 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COL19A1Q14993 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COL19A1Q14993 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COL19A1Q14993 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
COL19A1Q14993 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COL19A1Q14993 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
COL19A1Q14993 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
COL19A1Q14993 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
COL19A1Q14993 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
COL19A1Q14993 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
COL19A1Q14993 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
COL19A1Q14993 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
COL19A1Q14993 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
COL19A1Q14993 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
COL19A1Q14993 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
COL19A1Q14993 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
COL19A1Q14993 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
COL19A1Q14993 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
COL19A1Q14993 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
COL19A1Q14993 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
COL19A1Q14993 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
COL19A1Q14993 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
COL19A1Q14993 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
COL19A1Q14993 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
COL19A1Q14993 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
COL19A1Q14993 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
COL19A1Q14993 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
COL19A1Q14993 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
COL19A1Q14993 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
COL19A1Q14993 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
COL19A1Q14993 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
COL19A1Q14993 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
COL19A1Q14993 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
COL19A1Q14993 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
COL19A1Q14993 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
COL19A1Q14993 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
COL19A1Q14993 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
COL19A1Q14993 AC025154.2-203ENST00000550214 1031 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.8 ms