Protein–RNA interactions for Protein: Q14957

GRIN2C, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2C, humanhuman

Predictions only

Length 1,233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2CQ14957 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRIN2CQ14957 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
GRIN2CQ14957 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
GRIN2CQ14957 SRSF3-208ENST00000620941 869 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRIN2CQ14957 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
GRIN2CQ14957 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRIN2CQ14957 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRIN2CQ14957 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRIN2CQ14957 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRIN2CQ14957 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
GRIN2CQ14957 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
GRIN2CQ14957 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRIN2CQ14957 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRIN2CQ14957 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRIN2CQ14957 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRIN2CQ14957 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRIN2CQ14957 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRIN2CQ14957 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRIN2CQ14957 C12orf76-207ENST00000549724 1302 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRIN2CQ14957 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRIN2CQ14957 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRIN2CQ14957 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRIN2CQ14957 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRIN2CQ14957 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRIN2CQ14957 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRIN2CQ14957 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GRIN2CQ14957 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GRIN2CQ14957 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GRIN2CQ14957 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GRIN2CQ14957 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GRIN2CQ14957 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GRIN2CQ14957 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GRIN2CQ14957 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GRIN2CQ14957 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GRIN2CQ14957 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GRIN2CQ14957 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
GRIN2CQ14957 AK1-202ENST00000373156 757 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GRIN2CQ14957 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GRIN2CQ14957 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GRIN2CQ14957 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GRIN2CQ14957 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
GRIN2CQ14957 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
GRIN2CQ14957 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GRIN2CQ14957 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GRIN2CQ14957 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GRIN2CQ14957 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GRIN2CQ14957 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GRIN2CQ14957 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
GRIN2CQ14957 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GRIN2CQ14957 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GRIN2CQ14957 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GRIN2CQ14957 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GRIN2CQ14957 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GRIN2CQ14957 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GRIN2CQ14957 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GRIN2CQ14957 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GRIN2CQ14957 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GRIN2CQ14957 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GRIN2CQ14957 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
GRIN2CQ14957 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GRIN2CQ14957 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GRIN2CQ14957 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GRIN2CQ14957 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GRIN2CQ14957 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GRIN2CQ14957 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GRIN2CQ14957 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GRIN2CQ14957 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GRIN2CQ14957 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
GRIN2CQ14957 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GRIN2CQ14957 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GRIN2CQ14957 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GRIN2CQ14957 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GRIN2CQ14957 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GRIN2CQ14957 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GRIN2CQ14957 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
GRIN2CQ14957 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GRIN2CQ14957 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GRIN2CQ14957 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GRIN2CQ14957 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GRIN2CQ14957 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GRIN2CQ14957 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GRIN2CQ14957 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GRIN2CQ14957 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GRIN2CQ14957 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
GRIN2CQ14957 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GRIN2CQ14957 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GRIN2CQ14957 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GRIN2CQ14957 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GRIN2CQ14957 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GRIN2CQ14957 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GRIN2CQ14957 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GRIN2CQ14957 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GRIN2CQ14957 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GRIN2CQ14957 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GRIN2CQ14957 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GRIN2CQ14957 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GRIN2CQ14957 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GRIN2CQ14957 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GRIN2CQ14957 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GRIN2CQ14957 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms