Protein–RNA interactions for Protein: Q14722

KCNAB1, Voltage-gated potassium channel subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNAB1Q14722 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNAB1Q14722 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNAB1Q14722 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNAB1Q14722 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNAB1Q14722 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNAB1Q14722 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNAB1Q14722 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNAB1Q14722 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNAB1Q14722 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNAB1Q14722 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNAB1Q14722 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNAB1Q14722 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNAB1Q14722 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNAB1Q14722 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNAB1Q14722 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNAB1Q14722 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNAB1Q14722 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNAB1Q14722 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNAB1Q14722 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNAB1Q14722 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNAB1Q14722 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNAB1Q14722 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNAB1Q14722 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNAB1Q14722 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNAB1Q14722 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNAB1Q14722 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNAB1Q14722 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNAB1Q14722 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNAB1Q14722 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNAB1Q14722 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNAB1Q14722 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNAB1Q14722 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNAB1Q14722 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNAB1Q14722 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNAB1Q14722 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNAB1Q14722 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNAB1Q14722 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNAB1Q14722 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNAB1Q14722 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNAB1Q14722 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNAB1Q14722 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNAB1Q14722 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNAB1Q14722 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNAB1Q14722 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNAB1Q14722 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNAB1Q14722 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNAB1Q14722 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNAB1Q14722 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
KCNAB1Q14722 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
KCNAB1Q14722 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
KCNAB1Q14722 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
KCNAB1Q14722 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
KCNAB1Q14722 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
KCNAB1Q14722 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
KCNAB1Q14722 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
KCNAB1Q14722 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KCNAB1Q14722 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KCNAB1Q14722 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KCNAB1Q14722 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KCNAB1Q14722 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KCNAB1Q14722 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.08■□□□□ 0
KCNAB1Q14722 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KCNAB1Q14722 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KCNAB1Q14722 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KCNAB1Q14722 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KCNAB1Q14722 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KCNAB1Q14722 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KCNAB1Q14722 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
KCNAB1Q14722 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
KCNAB1Q14722 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KCNAB1Q14722 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
KCNAB1Q14722 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
KCNAB1Q14722 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC15.08■□□□□ 0
KCNAB1Q14722 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KCNAB1Q14722 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KCNAB1Q14722 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KCNAB1Q14722 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KCNAB1Q14722 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KCNAB1Q14722 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KCNAB1Q14722 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KCNAB1Q14722 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KCNAB1Q14722 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KCNAB1Q14722 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KCNAB1Q14722 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KCNAB1Q14722 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KCNAB1Q14722 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KCNAB1Q14722 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KCNAB1Q14722 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KCNAB1Q14722 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KCNAB1Q14722 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KCNAB1Q14722 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KCNAB1Q14722 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KCNAB1Q14722 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KCNAB1Q14722 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KCNAB1Q14722 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KCNAB1Q14722 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.07■□□□□ 0
KCNAB1Q14722 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KCNAB1Q14722 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KCNAB1Q14722 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KCNAB1Q14722 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms