Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMC1AQ14683 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMC1AQ14683 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMC1AQ14683 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMC1AQ14683 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMC1AQ14683 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SMC1AQ14683 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMC1AQ14683 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMC1AQ14683 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMC1AQ14683 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMC1AQ14683 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMC1AQ14683 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMC1AQ14683 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMC1AQ14683 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMC1AQ14683 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMC1AQ14683 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SMC1AQ14683 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMC1AQ14683 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMC1AQ14683 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMC1AQ14683 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMC1AQ14683 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SMC1AQ14683 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMC1AQ14683 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMC1AQ14683 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SMC1AQ14683 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SMC1AQ14683 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SMC1AQ14683 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMC1AQ14683 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMC1AQ14683 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMC1AQ14683 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMC1AQ14683 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMC1AQ14683 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMC1AQ14683 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMC1AQ14683 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMC1AQ14683 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMC1AQ14683 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMC1AQ14683 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMC1AQ14683 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMC1AQ14683 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMC1AQ14683 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMC1AQ14683 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMC1AQ14683 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMC1AQ14683 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMC1AQ14683 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMC1AQ14683 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMC1AQ14683 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMC1AQ14683 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SMC1AQ14683 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMC1AQ14683 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SMC1AQ14683 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMC1AQ14683 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMC1AQ14683 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMC1AQ14683 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMC1AQ14683 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMC1AQ14683 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMC1AQ14683 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMC1AQ14683 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SMC1AQ14683 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMC1AQ14683 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMC1AQ14683 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMC1AQ14683 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMC1AQ14683 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMC1AQ14683 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SMC1AQ14683 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMC1AQ14683 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMC1AQ14683 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMC1AQ14683 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMC1AQ14683 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMC1AQ14683 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMC1AQ14683 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMC1AQ14683 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMC1AQ14683 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMC1AQ14683 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMC1AQ14683 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMC1AQ14683 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SMC1AQ14683 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMC1AQ14683 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMC1AQ14683 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMC1AQ14683 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SMC1AQ14683 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMC1AQ14683 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMC1AQ14683 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SMC1AQ14683 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMC1AQ14683 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMC1AQ14683 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMC1AQ14683 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMC1AQ14683 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMC1AQ14683 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMC1AQ14683 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMC1AQ14683 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SMC1AQ14683 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMC1AQ14683 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMC1AQ14683 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMC1AQ14683 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMC1AQ14683 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMC1AQ14683 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMC1AQ14683 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMC1AQ14683 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SMC1AQ14683 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMC1AQ14683 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
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