Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

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Length 771 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
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SEMA3AQ14563 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMA3AQ14563 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMA3AQ14563 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMA3AQ14563 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMA3AQ14563 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMA3AQ14563 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMA3AQ14563 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMA3AQ14563 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMA3AQ14563 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMA3AQ14563 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMA3AQ14563 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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SEMA3AQ14563 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMA3AQ14563 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMA3AQ14563 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMA3AQ14563 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMA3AQ14563 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMA3AQ14563 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMA3AQ14563 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMA3AQ14563 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMA3AQ14563 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMA3AQ14563 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMA3AQ14563 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMA3AQ14563 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMA3AQ14563 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMA3AQ14563 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMA3AQ14563 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
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SEMA3AQ14563 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMA3AQ14563 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMA3AQ14563 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMA3AQ14563 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMA3AQ14563 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMA3AQ14563 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMA3AQ14563 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMA3AQ14563 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMA3AQ14563 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMA3AQ14563 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMA3AQ14563 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMA3AQ14563 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEMA3AQ14563 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEMA3AQ14563 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SEMA3AQ14563 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEMA3AQ14563 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEMA3AQ14563 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEMA3AQ14563 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEMA3AQ14563 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEMA3AQ14563 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEMA3AQ14563 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
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SEMA3AQ14563 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEMA3AQ14563 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEMA3AQ14563 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEMA3AQ14563 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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SEMA3AQ14563 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SEMA3AQ14563 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEMA3AQ14563 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SEMA3AQ14563 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
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SEMA3AQ14563 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEMA3AQ14563 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
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SEMA3AQ14563 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEMA3AQ14563 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEMA3AQ14563 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SEMA3AQ14563 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEMA3AQ14563 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEMA3AQ14563 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEMA3AQ14563 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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SEMA3AQ14563 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEMA3AQ14563 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEMA3AQ14563 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEMA3AQ14563 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEMA3AQ14563 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEMA3AQ14563 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEMA3AQ14563 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEMA3AQ14563 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEMA3AQ14563 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEMA3AQ14563 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEMA3AQ14563 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEMA3AQ14563 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA3AQ14563 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA3AQ14563 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA3AQ14563 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA3AQ14563 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA3AQ14563 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA3AQ14563 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA3AQ14563 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA3AQ14563 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA3AQ14563 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA3AQ14563 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA3AQ14563 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA3AQ14563 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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