Protein–RNA interactions for Protein: Q14258

TRIM25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25Q14258 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms