Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RUNX3Q13761 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RUNX3Q13761 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RUNX3Q13761 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RUNX3Q13761 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RUNX3Q13761 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RUNX3Q13761 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RUNX3Q13761 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RUNX3Q13761 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RUNX3Q13761 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RUNX3Q13761 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RUNX3Q13761 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RUNX3Q13761 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RUNX3Q13761 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RUNX3Q13761 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RUNX3Q13761 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RUNX3Q13761 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RUNX3Q13761 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RUNX3Q13761 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RUNX3Q13761 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
RUNX3Q13761 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RUNX3Q13761 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RUNX3Q13761 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RUNX3Q13761 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RUNX3Q13761 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RUNX3Q13761 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RUNX3Q13761 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RUNX3Q13761 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RUNX3Q13761 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RUNX3Q13761 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RUNX3Q13761 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RUNX3Q13761 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RUNX3Q13761 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RUNX3Q13761 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RUNX3Q13761 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RUNX3Q13761 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RUNX3Q13761 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RUNX3Q13761 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RUNX3Q13761 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RUNX3Q13761 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RUNX3Q13761 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RUNX3Q13761 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RUNX3Q13761 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RUNX3Q13761 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RUNX3Q13761 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RUNX3Q13761 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RUNX3Q13761 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RUNX3Q13761 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RUNX3Q13761 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RUNX3Q13761 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RUNX3Q13761 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RUNX3Q13761 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RUNX3Q13761 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RUNX3Q13761 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RUNX3Q13761 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RUNX3Q13761 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RUNX3Q13761 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RUNX3Q13761 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RUNX3Q13761 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RUNX3Q13761 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RUNX3Q13761 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RUNX3Q13761 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RUNX3Q13761 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RUNX3Q13761 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RUNX3Q13761 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RUNX3Q13761 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RUNX3Q13761 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RUNX3Q13761 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RUNX3Q13761 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RUNX3Q13761 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RUNX3Q13761 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RUNX3Q13761 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RUNX3Q13761 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RUNX3Q13761 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RUNX3Q13761 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RUNX3Q13761 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RUNX3Q13761 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RUNX3Q13761 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RUNX3Q13761 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RUNX3Q13761 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RUNX3Q13761 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RUNX3Q13761 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RUNX3Q13761 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RUNX3Q13761 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RUNX3Q13761 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RUNX3Q13761 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RUNX3Q13761 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RUNX3Q13761 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RUNX3Q13761 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RUNX3Q13761 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RUNX3Q13761 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RUNX3Q13761 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RUNX3Q13761 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RUNX3Q13761 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RUNX3Q13761 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RUNX3Q13761 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RUNX3Q13761 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RUNX3Q13761 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RUNX3Q13761 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RUNX3Q13761 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.6 ms