Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Length 1,029 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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