Protein–RNA interactions for Protein: Q13515

BFSP2, Phakinin, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BFSP2Q13515 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BFSP2Q13515 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BFSP2Q13515 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BFSP2Q13515 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BFSP2Q13515 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BFSP2Q13515 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BFSP2Q13515 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BFSP2Q13515 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BFSP2Q13515 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
BFSP2Q13515 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BFSP2Q13515 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
BFSP2Q13515 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BFSP2Q13515 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BFSP2Q13515 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BFSP2Q13515 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BFSP2Q13515 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BFSP2Q13515 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BFSP2Q13515 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BFSP2Q13515 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BFSP2Q13515 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BFSP2Q13515 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BFSP2Q13515 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BFSP2Q13515 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BFSP2Q13515 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BFSP2Q13515 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BFSP2Q13515 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BFSP2Q13515 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BFSP2Q13515 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BFSP2Q13515 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BFSP2Q13515 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BFSP2Q13515 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BFSP2Q13515 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BFSP2Q13515 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BFSP2Q13515 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BFSP2Q13515 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BFSP2Q13515 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BFSP2Q13515 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BFSP2Q13515 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BFSP2Q13515 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BFSP2Q13515 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BFSP2Q13515 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BFSP2Q13515 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BFSP2Q13515 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BFSP2Q13515 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BFSP2Q13515 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
BFSP2Q13515 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BFSP2Q13515 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BFSP2Q13515 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BFSP2Q13515 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BFSP2Q13515 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BFSP2Q13515 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BFSP2Q13515 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
BFSP2Q13515 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BFSP2Q13515 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BFSP2Q13515 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
BFSP2Q13515 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BFSP2Q13515 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BFSP2Q13515 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BFSP2Q13515 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BFSP2Q13515 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BFSP2Q13515 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BFSP2Q13515 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BFSP2Q13515 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BFSP2Q13515 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BFSP2Q13515 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BFSP2Q13515 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BFSP2Q13515 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BFSP2Q13515 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BFSP2Q13515 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BFSP2Q13515 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BFSP2Q13515 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BFSP2Q13515 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BFSP2Q13515 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BFSP2Q13515 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BFSP2Q13515 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BFSP2Q13515 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BFSP2Q13515 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BFSP2Q13515 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BFSP2Q13515 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BFSP2Q13515 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BFSP2Q13515 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BFSP2Q13515 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BFSP2Q13515 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BFSP2Q13515 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BFSP2Q13515 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BFSP2Q13515 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BFSP2Q13515 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BFSP2Q13515 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
BFSP2Q13515 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BFSP2Q13515 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BFSP2Q13515 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
BFSP2Q13515 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BFSP2Q13515 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BFSP2Q13515 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BFSP2Q13515 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BFSP2Q13515 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BFSP2Q13515 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BFSP2Q13515 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
BFSP2Q13515 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
BFSP2Q13515 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
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