Protein–RNA interactions for Protein: Q13404

UBE2V1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2V1Q13404 GAP43-202ENST00000393780 1901 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
UBE2V1Q13404 FAM224A-201ENST00000419557 2031 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
UBE2V1Q13404 FAM224B-201ENST00000458667 2032 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
UBE2V1Q13404 ODF2-213ENST00000448249 2059 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
UBE2V1Q13404 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
UBE2V1Q13404 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
UBE2V1Q13404 OR2V1-204ENST00000641551 2423 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
UBE2V1Q13404 NAA60-214ENST00000572584 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
UBE2V1Q13404 PTCHD3-201ENST00000438700 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
UBE2V1Q13404 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
UBE2V1Q13404 NRXN1-222ENST00000625672 8113 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
UBE2V1Q13404 CASS4-202ENST00000434344 2888 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
UBE2V1Q13404 KCNV1-201ENST00000297404 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
UBE2V1Q13404 TOP3B-202ENST00000398793 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
UBE2V1Q13404 DLL1-201ENST00000366756 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
UBE2V1Q13404 RASA4-203ENST00000461209 3244 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
UBE2V1Q13404 CC2D1A-201ENST00000318003 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
UBE2V1Q13404 AL590644.1-201ENST00000412427 4676 ntTSL 4 BASIC10.97□□□□□ -0.65
UBE2V1Q13404 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
UBE2V1Q13404 PCDHGA6-202ENST00000610583 5650 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
UBE2V1Q13404 TNS2-203ENST00000379902 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
UBE2V1Q13404 DHX38-201ENST00000268482 4608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
UBE2V1Q13404 FZD7-201ENST00000286201 3859 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
UBE2V1Q13404 AC010969.2-201ENST00000602458 3231 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
UBE2V1Q13404 LSINCT5-201ENST00000626215 2647 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
UBE2V1Q13404 FCHSD1-209ENST00000522783 2477 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
UBE2V1Q13404 LTF-202ENST00000417439 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
UBE2V1Q13404 SLC9A8-201ENST00000361573 6094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
UBE2V1Q13404 NECAP2-202ENST00000443980 1929 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
UBE2V1Q13404 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
UBE2V1Q13404 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
UBE2V1Q13404 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
UBE2V1Q13404 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
UBE2V1Q13404 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
UBE2V1Q13404 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
UBE2V1Q13404 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
UBE2V1Q13404 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
UBE2V1Q13404 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
UBE2V1Q13404 GAS6-AS1-201ENST00000458001 7169 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
UBE2V1Q13404 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
UBE2V1Q13404 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
UBE2V1Q13404 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
UBE2V1Q13404 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
UBE2V1Q13404 ADCYAP1R1-201ENST00000304166 6487 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
UBE2V1Q13404 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
UBE2V1Q13404 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
UBE2V1Q13404 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
UBE2V1Q13404 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
UBE2V1Q13404 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
UBE2V1Q13404 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
UBE2V1Q13404 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
UBE2V1Q13404 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
UBE2V1Q13404 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
UBE2V1Q13404 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
UBE2V1Q13404 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
UBE2V1Q13404 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
UBE2V1Q13404 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
UBE2V1Q13404 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
UBE2V1Q13404 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
UBE2V1Q13404 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC10.96□□□□□ -0.65
UBE2V1Q13404 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
UBE2V1Q13404 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
UBE2V1Q13404 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
UBE2V1Q13404 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC10.96□□□□□ -0.65
UBE2V1Q13404 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
UBE2V1Q13404 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
UBE2V1Q13404 FAM214B-208ENST00000605244 3016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
UBE2V1Q13404 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
UBE2V1Q13404 HTR5A-201ENST00000287907 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
UBE2V1Q13404 ZNF799-202ENST00000430385 2583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
UBE2V1Q13404 GUCY1B3-205ENST00000505764 2456 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
UBE2V1Q13404 LITAF-221ENST00000622633 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
UBE2V1Q13404 EGFLAM-204ENST00000397202 2398 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
UBE2V1Q13404 IL1RAP-211ENST00000439062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
UBE2V1Q13404 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
UBE2V1Q13404 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
UBE2V1Q13404 BDH1-202ENST00000392378 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
UBE2V1Q13404 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
UBE2V1Q13404 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.66
UBE2V1Q13404 METAP1D-201ENST00000315796 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
UBE2V1Q13404 EPHB1-201ENST00000398015 4672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
UBE2V1Q13404 ANKMY1-208ENST00000405002 3304 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
UBE2V1Q13404 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
UBE2V1Q13404 SPINT1-201ENST00000344051 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
UBE2V1Q13404 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
UBE2V1Q13404 TFAM-204ENST00000487519 5414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
UBE2V1Q13404 PLCB3-201ENST00000279230 4197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
UBE2V1Q13404 AP003555.1-202ENST00000511013 1755 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
UBE2V1Q13404 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
UBE2V1Q13404 TBC1D13-202ENST00000372648 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
UBE2V1Q13404 RAP2B-201ENST00000323534 8351 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
UBE2V1Q13404 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
UBE2V1Q13404 WWTR1-203ENST00000465804 5030 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
UBE2V1Q13404 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
UBE2V1Q13404 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
UBE2V1Q13404 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
UBE2V1Q13404 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
UBE2V1Q13404 CREB3L4-204ENST00000368603 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
UBE2V1Q13404 PRKCH-201ENST00000332981 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
UBE2V1Q13404 LAMA3-202ENST00000313654 10661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms