Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms